Basic Information

Symbol
COBLL1
RNA class
mRNA
Alias
Cordon-Bleu WH2 Repeat Protein Like 1 KIAA0977 Cordon-Bleu Protein-Like 1 COBL-Like 1 Cordon-Bleu WH2 Repeat Protein-Like 1 COBLR1
Location (GRCh38)
2:164653624-164843679
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001365672.2
Sequence length
9309.0 nt
GC content
0.3785

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2259.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2451.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2266.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001278458.2 NCBI
CCUCUCUCCGGCUCGCUGCUUCCCUCGCUCCAAUGCCGCCGAGCUGGUC… 9492 nt 0.3822
NM_001278460.2 NCBI
CCUCUCUCCGGCUCGCUGCUUCCCUCGCUCCAAUGCCGCCGAGCUGGUC… 9315 nt 0.3800
NM_001278461.2 NCBI
AGACCUUGUAGAGACGGCGGCGGCGCCCGCGGGCUGGGAGCCGGGGCCC… 9381 nt 0.3840
NM_001365670.2 NCBI
CCUCUCUCCGGCUCGCUGCUUCCCUCGCUCCAAUGCCGCCGAGCUGGUC… 9312 nt 0.3800
NM_001365671.1 NCBI
CCUCUCUCCGGCUCGCUGCUUCCCUCGCUCCAAUGCCGCCGAGCUGGUC… 4145 nt 0.4478
NM_001365672.2 NCBI
AUUCAAGUCCUGGCUUGAGAGCCGAGCGGCAAGAGCGCGGGCCGGGGAA… 9309 nt 0.3785
NM_001365673.2 NCBI
AUUCAAGUCCUGGCUUGAGAGCCGAGCGGCAAGAGCGCGGGCCGGGGAA… 9280 nt 0.3781
NM_001365674.2 NCBI
AUUCAAGUCCUGGCUUGAGAGCCGAGCGGCAAGAGCGCGGGCCGGGGAA… 9348 nt 0.3785
NM_001365675.2 NCBI
AUUCAAGUCCUGGCUUGAGAGCCGAGCGGCAAGAGCGCGGGCCGGGGAA… 9319 nt 0.3782
NM_014900.5 NCBI
AGACCUUGUAGAGACGGCGGCGGCGCCCGCGGGCUGGGAGCCGGGGCCC… 9495 nt 0.3858
Summary

Enables cadherin binding activity. Located in extracellular exosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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