Basic Information

Symbol
ADCY9
RNA class
mRNA
Alias
Adenylate Cyclase 9 AC9 ATP Pyrophosphate-Lyase 9 Adenylate Cyclase Type IX Adenylate Cyclase Type 9 Adenylyl Cyclase 9 EC 4.6.1.1 ACIX Type IX ATP Pyrophosphate-Lyase KIAA0520
Location (GRCh38)
16:3953387-4116442
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001116.4
Sequence length
7980.0 nt
GC content
0.5786

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3222.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3348.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1676.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((((((..((((...(((((..((((((((((((((((....((((.((((((((((((((((((..((((..(.((((((..(((((((((((.(((((.....))))).))))))(((((((((((((((((..((.(((((((((((.(.(((..(((((((((((....((((((..(((((((.(((((((((.((..(.(((((((((((.(((..((........))..))))))).)).).)))).).)).)).))))))).)).....((((........))))...))))).))))))....)))))))).)))...))).).)))))))))))))..)))..))))))).))))).))....(((((((((((.((.((((...(((((..((((((((((((((.((...)).)))..)))))).))))).)))))...)))).)))).)))))))))(((((((((((((..(.......(((((((((((....(((.((((((((((((((((((.(((.(........).))).))))))..)))))))(.(((.(......).))).).))))).))))))))))).))))..))))))).)))))).((((((((.....((((((((((((((....))))(((((((.....((((((((((.((((((..((((...((((((((..((((........(((((((......(((((((((((((((((.....))))((((((....)))))).............(((((((....(((((((((.(((((((........))))...(((((...((.(((...((((((((.((((....((.(((...................(((((((.(((((..(.(((.((((((((.(((((..((.((......)).))..)))))..))).)))))((((((((((...)))))))..))).))))..))))).)))))))))).)).......)))))))).)))).)))))...))))).))).)))))))))...(((.(((((......))))).))).))))))))))))))))))))..)))))))........))))))))))))....))))...........)).)))).))))))))))((((((.......)))..))).(((((((((......)))).))))).)))))))))))))))))))))))))((((...((((((........))))))...))))..))))).)))))).)......))))..)))))).((((((((..(((((((((((((((((((.(((((((...((.(((((((((.((.((((((((....)))).)))).))(((((.(((((((((((.....(((((((.(((((((..(((((......(((((((...)))))))(((((...((((((......................)))))).....))))).)))))..)))))))))(((((((......(((........)))....)))))))...((((((..((((....))))......))))))))))))))).....((((((..((.(((((((((((((.(.....(((((....)).)))...).))))).)))))))).))..)))))))))))))...)))))..((((((((.((((((....)))))).))...))))))))))))))).)).....))))......((.(((((..((((((((.(.((.((..(..((((.............))))..)..))..)).).).))))))).))))).))((((((..(((((((..((((.....((...((((((.....)))))).))......))))............((((.(((..((((((((((......(((((....)))))....((((((...((.(((((((......)))).))).))..))))))((((((..(((((((((((((((((.....))))((((.(((((((.....)).))))).))))..((((((.....))).)))...))))))))..)))))..)))))).(((((......))))).((((.......)))).)))))))))).))).))))((((((((((((...(((.((.((((((((((((((.(((...(((((((((((..(((..((((.((((.......((((..(((.(((((((((.(((((((..((((((((((....((((.((.((((((((..((((((((((((((((.(((((.(......)))))).)))))))....)))))))))..)).))))))))))))..........))))((...(((((((..((((((.(((.....(((((((.((((..((((.(((((.((((((.......((((.((....)).)))).......))))))..)))))....(.((((((((((((((...((((...((((.(((((((...((((((((((((.(((((.(.(((((((...(((...)))...))))))).))).....)))..))))))))))))))).)))).(((((((...))))))).........(((.(((((.((((((..(((.(((((....))))).)))..)).)))).))))))))))))))))...))))))))..)).)))))..............((((((((..(..(((((((((((........(((((((((....))))).........(((((((((.((.....)).)).)))))))((((((((....((((((((((((..(((((((.((((.(.((.(((..(((.(((........)))))).((((..((((((((((((((......((((.((((...)))).))))(((...((((.(((.((((.....(((((..................)))))...)))).)))..))))...)))..((((((((((..........((((.(((..(((((..(((.((.....)).)))..)).)))........))).))))...)))))))))))))))))))))...)))...))))((((((((...)))))))).......(((((((.........)))))))...))).))).)))).))))))).))))((((((..(((((((.(((.......((((((((((((.....)))).((((.((((((.(.....).)))))).))))(.((.(((((......)).)))))).(((((((((.(((((.((((......))))..((((((((.....)))))))).((.....)).))))).))))))))).....)))))))).....(((.((.....(((((....))))).....)))))))).)))))))..)))))).((((....)))).((((.((..((((((((..(((.(((((.....)))))))).(((.(((((((.((((((((((.....(.((.((((....((((......))))(((((((((....(((.....)))...))))))))).....(((((....)))))(((.((....)).)))....)))))).)..))))))))))....(((((.(((((((((((....))))........(((((((.((((((((.(((((.((.((....(((....(((((((.(((.((((((((........))))..)))).))).)).))))).)))..)).)).))))).)).)))))).)))).)))))))))).)))))........))))))).))).)))))))).)).))))..(((...)))...............(((((((((((.(((((...)))))...............((((((...((((.(((.(((....(((((((((((((((((..(((((.(((((.(.(((((.((((((.((((((..(((((((..((..((((((((((((((.......((((..........(((..(((((((.(((((((.((((.(((((............)))))..)))).).)))....(((((....)))))...((((...((....))...))))....))).)))))))...)))))))..........)))))))))))........((((((((((((......((...((((((........))))))...)).....(((..((((((..(((......((......)).......))).))))))..)))......))))))))))))..........)))..))..)).)))))...((.......))(((((.((((((((((((((((.((((((((((((((.(((((..(((..(((..((........)).)))...)))....)).)))..)))).(((....)))..((((((((((((((.....((((((.((((((......))))))((((.((..((.(((((((........)))))))))....)).)))).((((((((.....))))).)))....))))))..(((((((.(.(.(((..((...(((((((...(((((((...(((.((.(((..((((..((((.............((((((((...((((...))))(((((...(((.(((((((((..((((((((((((.(((((((.((((((((...((((...........))))..))))(((((((......)))))))((((.((((.(((((....))))).))))...)))).....((((((.((((((...)))))).))))))(((....(((((.((((((((.(((((.......((((((.....(((((.....)))))......))))))............................((......)).......((((....(((.....)))..))))((((((.(((((((((....(((((.(((.((((((.(.(((((...))))).).)))))))))..)))))(((((((((((..((.(((.........))).)).)))))))))))(((((......)))))))).)))))))))))).))))).)))))))).)))))......))).........))))))).)))).))))))))))))...)))))))))))).))))).....))))))))...(((..(((....)))..)))..(((((....(((......)))....)))))((((.(((((((((...(((((((.(...(((((.(((....)))))))).))))))))...(((......))).....(((.((((.(..((((((((((((((((((((((.(....(((((.....)))))....).)))))))))))).)).....(((.............))).(((((((((.((....)))))))).)))...((((((...((((....)))).))))))((((((((((((.(((((((((((.(((((((((.(.(((((((((((.....((((....))))...))))....)))........((((.(((.......................))))))).)))).).)))))))))..))))....))).)))).)))))))))))).........(((((((((.((.((((((..((((((((((.......)))).)))...))).)))))))).))))......)))))(((((....)))))((((((.(((((((...((((.....))))........(((.((((....((((..(((......)))(((((((.......))))))))))))))))))))))))).))))))..))))))))..).)))))))..((.((.(((((((((.(((..(((.(((((.....)))))..)))..)))..........))))))))).)))).......)))).)))))....))))(((((........)))))...))))..))))..))).)).))).))))))).)))))))....))....))).).))))))))(((((((.((((.............))))..))))))))))))))))).)))))))))).))))...........((((((.((........)).)))))).....(((((....)))))....)))))))))))))))).)))))))))))..)))))))).)))).)))))))).))..)))))))))))).)))))....))).))).))))...)))))))))))))))))..)))).)))).....)))))))).(((((((......((((.(((((.(((..((((((((..((((...(((.((((.((((.......((((......))))(((((.(((....)))))))))))).)))).)))((((...(((((.(((((.(((..(((....((.((((((......)))))).))....)))....))).)..)))))))))...))))...))))..)))).))))(((((.......))))).)))))))).)))).(((((.((((.......))))..)))))............((..((((((........))))))..))..))))))).......))))...))))))).)))).)..))))).)))..((((((........)))))).....((((((((.............((((((.(((((....))))).))))))..))))))))))))..).))).))))).))((..(((((.(((...)))..)))))..))........))).))))))....)))))))...)).....((((((....))))))..)))))).)))((....)).)))))))))))))..(((((((.............))))))).(((((((...((((((..............(((.((...........)))))....))))))..)))))))..)))..))))..((((.....)))).)))).))))..)))..))))....((((((...........))))))((((.....))))..))))))).))).))))).((.(((......((((((((((....)))))).))))))).))...))))))))))).)))...)))))))).)))))))))))...)))))))))...)))))))..((((.....)))).((((((..(((((((..(((((((.(((((((((..((((..(......)..))))..))))))))).).))))))....(((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))).......)))))))..........))))))...........))))))))))................))..)))))))).....((((((.((......(((((.(((.......))).)))))..(((((((...))))))).................))))))))...)))))).)))))).))))....))))))....((..(((((...............)))))..))((((((.(((((((..(((((.((.((.((((((((........))))))))..)).)).)))))))))))))))))).............))).))).))))..))))).....))))....)))))))((((.(((((((((....))))))))).)))).))..)))))...................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..(((((((((..(((({..(((((,,{{((((((((((((((....((((.((((((((((((((((((..((((,{(,((((((..(((((((((((.(((((.....))))).))))))(((((((((((((((((.{((.(((((((((((,,.(((..(((((((((((....((((((..(((((((.(((((((((.((..(.(((({((((((.(((..((........))..))})))).)).).)))).).)).)).))))))).))....,((((........))))...))))).))))))....)))))))).)))...))).).)))))))))))}).})))).))))))),})))).))....(((((((((((.((.((((...(((((..((((((((((((((.((...)).)))..)))))).))))).)))))...)))).))))})))))))))(((((((((((((..{.......{((((((((((....(((.((((((((((((((((((.(((.(........).))).)))))).,))))))){.(((.(......).))).}.))))).))))))))))).)))}..))))))).)))))).((((((((.....((((((((((((((....))))(((((((,,,,{((((((((((,((((((..((((,,.((((((((..((((......,.(((((((......(((((((((((((((((.....))))((((((....)))))).............((((((({,,.(((((((((.(((((((,.......}}}}...(((({,..((.(((...((((((((.((((..,.((.((({,{,........,,.....{{(((((.(((((....(((.((({,,{{.{(((,..,,.{|,....,||,,|||))}})}}))).))))){({(((((((...))))))).,})},))|}||))))).)))))))))).)).,.....)))))))).)))).)))))...))))),})).)))))))))...{{{.(((({......})))).))).))))))))))))))))))))}.))))))).,......)))))))))))).,,.))))...,....,,,))))))).))))))))}|((((((.......)))..))),(((((((((......)))).))))).)))))))))))))))))))))))))((((.{.((((((........))))))...))))..))))).)))))).)....}}))))..)))))),(((((((,..,{(((((((((((((((((.(((((((...((.(((((((({.((.((((((((....)))).)))).)}(((((.((((((((((,....{(((((((.(((((((..(((((......(((((((...}))))))(((((..{((({((.......,,...........,,))))}}.....))))}.)))))..)))))))))(((((((......(((......},))}....)))))))...((((((.,((((....}}}}...,,,))))))))))))))).....((((((..((.((((((((((({{.(,{{..((({(....}}.)))...)}))))).)))))))).))..)))))))))))))...))))).,((((((((.((((((....)))))).))...))))))))))))))).)).....)))),,,...{{,{{(((..{(((((((.(.{{.((..(..((((,,....,,.,},.,))}..),.))..)),).},}||}}}}.))))).))((((((.,(((((((..((((.....{,...((((((.....)))))).,,......))))............((((.(((..((((((((((......{{,{,....,,,},....((((((.,.((.(((((((......)))).))).})..))))))((((((..(((((((((((((((((,...,))))((((.(((({{(,....},,))))).))))..((((((.....))},)))...))))))))..)))))..)))))).(((((......))))).((((.......)))).)))))))))).})).))))((((((((((((...(((.((.((((((((((((((.(({...{((,(((((,(..,,(,,(((({(((({,.,,.{((((.{((,.(((((((((.(((((((..(((((((((({{{,((((.((.((((((((..((((((((((((((((.(((((.(......)))))).)))))))....)))))))))..)).)))))))))})),,..}}},,.}}}}((...(((((((..((((((.(((....{(..(((({{(((..((((({(((((..(((((((.,,..,,.(((({(.((((((((((,..{(((((((((({,((((.,((((.{((((....)))))))})))))))))))))))}.((((((({,(.((((....{((.(((....))))}}.(((.((((((((({(((((,{,({{{..,{||,{}},.,|||||}.,..{||||{,...,)))))).,}}...,,|,,.(((((.((((((..(((.(((((....))))).)))..))}}))).)))))(((((((.,......(((((.(((.((((.((.........)).....(((....(((((((((.((((.........,...(((((....))))).......,,{((((((((.((.....)}.}).)))))))||,||{(..{{.(((((((.((((..(((((((.((((.((((,(((..(((.(((........)))))),{({|,,((((((((((((((......((((.((((...)))).)))){((...((((.(((.((((.,,.,({{{,|||....,,,........}}}}},..)))).)))..)))).,.)}}..((((((((((.,........((((.(((..(({((..(((.{(.....)}.)))..)).}))..,.....))).))))..,)))))))))))))))))))))...)))...)))}((((((((...)))))))).......{((((({....,,,,.}}))}))...}}).)))))))))))))))).))))((((((..(((((((.(((.......{(((((((({(,.....}}}}{((((.((((((.({....).)))))).))))|.|..(((((......)).))),},.(((((((((.(((((.((((......)))}..((((((((,...,)))))))).((.....)).))))).))))))))).,.}.)))))))}.....(((.((.....(((((....))))).....)))))))).)))))))..)))))).((({....}))).))))))).}}})}},},...)))).)))))))))...)))..)))).))).)))))....|.))))))),,,....))).)))))).))).{{.(((((((((((..,.{((.....,)}.}.)))))))))))}}.(((((....)))))(((.((....)).))).))))))))))))).((((...))))..(((((.(((((((((((,,,.||}),.,.,|..(((((((.((((((((.(((((.((.((....(((....(((((((.(((.((((((((........))))..)))).))).)).))))).)))..)).)).))))).)).)))))).)))).)))))))))).)))))........,,,|,,,..,}}))||}}((((((((((((((((..((({,.............(((((((((((,(((((...))))).,,.{{{{........|||||}|.{(((.(((.(((....(((((((((((((((((.,(((((.(((((.(.(((((.((((((.((((((,{(((((((..((..((((((((((((((...,...{{{{,,........(((..(((((((.(((((((.((((.(((((,..,......,.)))))..)))).).)))....(((((....)))))...((((...((....))...))))....})).)))))))...)))}})}..........)))))))))))........((((((((((((......((.,.((((((........))))))...}}.....(((..((((((..(((....{(({{.....}).},....))).))))))..)))......))))))))))))..,.......)))..))..}).)))))...||,||,,..}}{((({.((((((((((((((((.{{{{{((({((((.{((((..(((({.{((...{.,,..,.||}.{{(((((.....))))).)).,....(((,...)))(((((....))))}.,.,,))))).))|}|,|||}}}|.,|}}|||({{{.|{,.((.(((((((........)))))))))....)),)))).||((((((.....)))))}.|{{{.{((,({((.((,{{..,.,{{{(({|{(...(((({{{,.,{((({({...,(({(,,({({.{(((((({{{,..,{{,,,,{{.{{((((((...((((...))))(((((...(((.(((((((((..((((((((((((.{((((((.((((((((...((((...........))))..))))(((((((......))))))).((((,(({.(((((....))))),|}},....,,},....((((((.((((((...)))))).))))))|||}}}.(((((.((((((((.(((((.......((((((.,...(((((.....)))))....,.))))))............................,.......))}......((((....{{(|...,))}..))))((((((.(((((({((....(((((.(((.((((((.{.(((({...})))).}.)))))))))..)))))(((((((((((..{{.,,,.........}},.,).))))))))))){{(((......})))}})).)))))))))))).))))).)))))))).)))))......||,.....,,..))))))).)))}.)))))))))))).,.)))))))))))).))))),}}}})}}}})}},..{((..((,....})},,|}}..,{{{(,,..(((......}}}...,|||||(,,({.....({(({,.(((((((.,...(((((.(((....)))))))).})))))))..}|||..,}..)))}}},.{{{.(({(,({,{{{|||||||((((((((((((.(....(((((.....)))))....).)))))))))))).)}.,{,{(((({{{{..((,..{||..((((((((((((.,,,|||}|}}}.|))...((((((...((((....)))).))))))((((((((((((.((((,((((((.(((((((((.(.((((({{((({,,..,({((,...||||,..||}.....)).........||||,|||.,....,{.......}.......)))))))})))).).)))))))))..))))....})).)))).))))))))))))...,,,...(((((((((.(,{((((((..((({((((((.......}))).)))...))).)))))))).)))}.....,))))){((((....))))|((((((.(((((((...((((.....))))........(((.((((,...{(((..(((......)))(((((((.......))))))))))))))))))))))))).)))))),.}))))))}}}).))))))),.||,,,.{|||,,||}}|||},,||........,,,.,,,)},}))}},))},}}},}}}},},})),)),)))}...||,{{|||{||{|.{{{{|,,|(((.({....{{{|||{{,..{{||{{||||{{|||{|{{{||{|||,|,,.,}}.)))))}}))...{.{{{{|||||{,...}))}}}}))))).},.,))))))}})}}))))))),,})),)))))).,.,)),)))).,,.))))).))}})))}}}.,}}}})}}...))))))))),..)}.}),,,)}}}))).)))).)))))))))))))))).})))}))))))..)))))))).)))).)))))))).}),,)))))))))))).)))))....))).))).)))|,,.,,)))))))))))))))(((((...((((((...........................................))))))...)))))(((.((((.((((.......((((......))))(((((.(((....)))))))))))).)))).)))......{((((((.(((.({{(...,}),,.)))))))))),.)))..)))))))).......)))))))).,}}},.}}))))))))))).)).))))})}))))))),,,,,,....},|{{{((((,((,.(,{{{(((((.((((.......))))..))))}.....{{{{{...,..,,{((({,......)))))}...,..{((((((.......{((((((,,|{{....))).))))))}}.......)))))))......))))).........}))}}..,}...}}}},,|(((((.(((((....))))).)))))},{|||{|...}}}},,},}}..)),,},,,)}}}||{{|,|||,,.)),..))}},}))..}}.....))).))))))....)))))))...)).....((((((....))))))..)))))).)))||,,..}}.}})}))))))))),)|,|||||,,.,.,}}}}}.,)}}}))).(((((((...((((((,.............(((.((...........))))).),,))))))..)))))))...||..||||..,|||...,}})))})}))}}))).,|||{,|.,.....{(((((...........))))))(((,...}}).}}|})))}}}|,||}.}})))}|(,{{{......((((((((((....)))))),,)))}))}))...})))))))))).)))...))))))))}})))))))))).,.)))))))))...)))))))..((((.....)))).(((((({{(((((((..(((((((.(((((((((..((((..{......}..))))..))))))))).),)}))))....(((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))).......,,)))))},........))))))........,,.))))))))))................,}..))||||||.....||||||.{,......(((((.(((.......))).)))))..(((((((...))))))).....,,....,,....}))))))),..)))))).)))))).))))....))))))........{((.((({....})))}}.{(((({.((.((((((.(((((((..(((((.((.((.((((((((........))))))))..)).)).)))))})))))))))))).)).,.))},)}.))).))))}.}),.))))).....)))),...))))))),(((.(((((((((....))))))))).)))}.))..)))))..,....{{,,..........,))},.........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001116.4 NCBI
AGUGACAGCGGGCGGGGCAGGGGCCGGAGAUGGUGGCGGCGGCAGCUCU… 7980 nt 0.5786
Summary

Adenylate cyclase is a membrane bound enzyme that catalyses the formation of cyclic AMP from ATP. It is regulated by a family of G protein-coupled receptors, protein kinases, and calcium. The type 9 adenylyl cyclase is a widely distributed adenylyl cyclase, and it is stimulated by beta-adrenergic receptor activation but is insensitive to forskolin, calcium, and somatostatin. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in postmortem human brain tissue from male Mexicans demonstrated that the ADCY9 was significantly hypomethylated and overexpressed in the prefrontal cortex of individuals who died by suicide compared to sudden death controls [Romero-Pimentel et al. DOI:10.1093/ijnp/pyab042].