Basic Information

Symbol
COMT
RNA class
mRNA
Alias
Catechol-O-Methyltransferase Catechol O-Methyltransferase EC 2.1.1.6 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Li 98n Testicular Tissue Protein Li 42 HEL-S-98n
Location (GRCh38)
22:19941371-19969975
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000754.4
Sequence length
2272.0 nt
GC content
0.5911

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-923.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -959.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 518.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000754.4 NCBI
AAUCCCCGCAGCGCCACCGCCAUUGCCGCCAUCGUCGUGGGGCUUCUGG… 2272 nt 0.5911
NM_001135161.2 NCBI
GCAGAGGGCAUGAUCAGCAGGGCUCCAGUAAGACGCUCCCACGGGAGGA… 2297 nt 0.5808
NM_001135162.2 NCBI
AGAGUGGAGAUAACACGGAUCGCUGUGUACACUGUGUGCUCCGGUUGUU… 2283 nt 0.5769
NM_001362828.2 NCBI
AAUCCCCGCAGCGCCACCGCCAUUGCCGCCAUCGUCGUGGGGCUUCUGG… 2566 nt 0.5986
NM_007310.3 NCBI
GGCAGCUGUGUUGCUGGGCCUGGUGCUGCUGGUGGUGCUGCUGCUGCUU… 2029 nt 0.5781
Summary

Catechol-O-methyltransferase catalyzes the transfer of a methyl group from S-adenosylmethionine to catecholamines, including the neurotransmitters dopamine, epinephrine, and norepinephrine. This O-methylation results in one of the major degradative pathways of the catecholamine transmitters. In addition to its role in the metabolism of endogenous substances, COMT is important in the metabolism of catechol drugs used in the treatment of hypertension, asthma, and Parkinson disease. COMT is found in two forms in tissues, a soluble form (S-COMT) and a membrane-bound form (MB-COMT). The differences between S-COMT and MB-COMT reside within the N-termini. Several transcript variants are formed through the use of alternative translation initiation sites and promoters. [provided by RefSeq, Sep 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.