Basic Information

Symbol
CORO1C
RNA class
mRNA
Alias
Coronin 1C Coronin-3 HCRNN4 Coronin-1C Coronin, Actin-Binding Protein, 1C Coronin, Actin Binding Protein, 1C CRNN4 CRN2
Location (GRCh38)
12:108645109-108732563
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014325.4
Sequence length
3814.0 nt
GC content
0.4565

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1164.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1242.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1146.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001105237.2 NCBI
AGGACCCUGGCCACGAAUCAUUUGCCAUCUCCUCUACCAAAGACUCAAA… 3939 nt 0.4521
NM_001276471.2 NCBI
GCGAGACCAGCUCUGGGCCCUGCAGAUCUCGGUUGGGGGUCAGGCGGGG… 3945 nt 0.4621
NM_014325.4 NCBI
AGUGCCAGGCUGGAGGCGGCAGCGGUUGGAGGCUUCGCCCGGCUUUGCA… 3814 nt 0.4565
Summary

This gene encodes a member of the WD repeat protein family. WD repeats are minimally conserved regions of approximately 40 amino acids typically bracketed by gly-his and trp-asp (GH-WD), which may facilitate formation of heterotrimeric or multiprotein complexes. Members of this family are involved in a variety of cellular processes, including cell cycle progression, signal transduction, apoptosis, and gene regulation. Three transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.