Basic Information

Symbol
CPAMD8
RNA class
mRNA
Alias
C3 And PZP Like Alpha-2-Macroglobulin Domain Containing 8 KIAA1283 K-CAP VIP C3 And PZP-Like Alpha-2-Macroglobulin Domain-Containing Protein 8 Alpha-2 Macroglobulin Family Protein VIP ASGD8
Location (GRCh38)
19:16892951-17026815
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015692.5
Sequence length
5983.0 nt
GC content
0.6156

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2650.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2747.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1541.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((((((((((((...(((((((((((.((((.((((((((..........))))))))))))..))))((((..(((((.(((.((...(((((....).)))).)).))).))))).)))).)).))))).))))))).(((((((.(......((((((((.((......)).))))))))).))))))).((((((.(((...))))))))).((((....))))(((((((((((((..(((((((....((..((((.((((..(((((((.(((((((.(((((....(((((((((((((((..((....(((((((......(((((.((...(((((((.((.((((((....((..((((.(((((.(((((.((((((((((.(((.....(((.(((((((((((((((((((((((((((.(((.((((..((((((....))))))..)))).)))..)))..(.((((((((....)))))))).).(((.......)))..))))))......((((....(((((((.(((((....)))......)).))))))))))).)))))(((((((....)))).))).((((((((.((((.....((((..(((...((.(((..((((((((((((((.(((.((....)).))).))))).)))((((....))))....(((((......))))).(((......))))))))).))).)).)))..))))...))))))).))))).((((((....))))))...(((.((((((((........((((((...)))))))))))))).))).....))))).)).)))))).))).(((.((((((.((..(.((((.((((((((...))))))...)).)))))..))))))))...)))..(((((((((((((((((((((.((.((((....)))).)).)).))))))))..))))))).))))(((((.....)))))........))).)))....))))))).)).))).(((.(((((....((((.....)))).))))).))).....))))).))))..)))))))).)).))))))))).))))).....)))).)))....))..))))))))).))))))))))).))))))))))))))(((((((((.((((.......(((((.((((.((((((((.....(((((....(((..(((((((((.((.(((....)))((((((..((((......))))..))))))((((((((......((((.((((..(((....((((...))))......))).)))).))))......)))))).))((((........)))).)).)))))))))..))).((((((.(((((((.((....((((...(((((((.(((((...)))))(((((...((((((.....((((.((........)).)))))))))))))))...)))))))))))....)).)))))))...((((.((......)).))))((((((.....))))))((((.....))))((((((((((...(((((.(((...))).))))).)))).))))))....)))))).(((((((..((((((((((((.....((((((((((..((((.(((.((((..(((..(((..((((......)))).........(((((...)))))....(((..(((...((((..(((((((((....)).))))))).))))....))).)))....)))))).))))))))))).))).))))))).....((((((((((.(((((((((..(((((..((((.((.........)).)))).))))))))))(((((((.((...(((.((.(...(((((...((.(((((((((((((.(((((((((((.(((((..((.((((((.....)))))).)).........)))))))))))).........)))).))))))).)))))).))))))))))))).)).)))))))(((((((..............)))))))))))))))))))))..(((((((((...))))))))))))))).))))))..))).)..)))..)))))......))).))))))))).)))))((((((((....(((.((((((...(((((((((((..((((.((((.((.(.((.((....(((.(((((....((((((((.((((...((((((.........))))))))))..(((....)))(((.....))).))).)))))....))))))))...)))).).))))))......(((((((........)))))))))))....(((.......)))((((((..((((((........))))))..)))))).)).).)))))))))))))).)))........(.((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((((.(((...)))))))))).......(((((............)))))((((((((..((((((((((...........))))))))))((........)).....(((((((........))))))).(((((((((((((((..((.(((((.((...)).))))).))..((((((((((...))))))))))(((((...((((......)).))))))).(((((((.((((...((...((((((((..(((.....)))))))))))..((((((..(((((((((....))).(((((..(((((.((.....)))).)))((((.....)))))))))....(((((.(.((.((((.((((..((......))..)))).)))).)).).)))))......))))))))))))..))....))))))))))).)))))))).))))))).(((((((...))).)))))))))))).....................)))....))..)).)))).)))))).).))))))))))))).).(((((((.....))).)))).))))))))..(((((((.((.(((((((((((.........((((.(((((....)))))))))..))))).)))))).)).))))))))))).))))))))).....(((((((....(((((.(((....)))))))).....)))))))))))...(((((((....)))))))(((((((((((((((((((.....(((.((((.((((((((.((((..((((((.....))))))))))))))))).....).)))))))..((((..((((...((((((((((((((((((((.((.(.(((((...((((.........))))(((((((((((......(((.(((..........((((.((((((.((....)).)))..))).))))))))))......)))))))))))..(((((((((..((((........(((......))).....((((.((((((.......)))))))))).(((((...........))))).)))))))))))))..((((((...))))))...)))))).)))))))))....))))))...)))).)))..)))))))).....)))))))))).)))))))))..........((((...)))).....((((((((..(((..(((((((...(((((..(((...((((...))))..)))))))).))))..))).((((..(((((((.((..(((((((.((...(((.((((((....))))...((((((...)))))).((((((((((.((((((.......)))))).)))...(((((.....))))).(((((((((((((..........))))))).....((((.((((((((...(((((((......((((...))))......))))))).....)))))......)))))))....))))))..)))))))))))).)))))))))....)).))))))).))))....)))))))))))...))))))...))))))).....))))))))..)))))..))))))).)))))))))...((.(((.((((((((...((((...(.((((((..(((((((..........(((((((......((((.((.((((.(((...))).)))).))(((((((...(((((....(((((.((((.((((((((..(((((((((((((((((((((.((((...(((((((((((((((...(.(((((....))))).)....))).((((((.....))))))...((((((((((((......))))))...((((.......))))...)))))).....(((((((..........)))))))..(((((((((((.(((((.((((.(((..((..((((.((((((((((((........)))))))(((.(((((((..(((((((((((.....)))))).((((.(....))))))))))..))))))).))).))))).)))).))..)))...((((..((((.....((((...))))(((((((((...(((((..((.((((((((.(((((((((.((((((((.((((.((((((((.((..((((((((.(((...((.((....)))).))))))))).))..((.(((((.((.(((..(((((((((((..(....)..))))))))))).)))(((((((....)).))))))).))))).))....(((((((((...((((.((..(((((.((((((((.(((.......))).)))))))))))))..)).))))))).))).)))((((((...((((((.((((.((((.(....).))).).))))))))))......))))))((((((.(((..((....))..))).))).)))....)).)).)))))).)))).)).))))(((.(((((.(((((((((((....))).))....((((((.(((((((....(((((.......(((((...(((.(((((((((((.((((((((.((.((((.(((((((((..(.....)..)))))).........))).)))))))))))))).))))))).))))((((((((.((((((.....)))))).)))..(((.....)))((((((........))))))((((.((((...((((((((.(((((((..((((((((((.((.((((((((.(((....))).))).)).))).))..))))))).))).)))))))))))))...((((((((((........))))))))))..((((..(((((((.((......)))))))))..)))).....)))))).)))).......)))))..)))..)))))..))))).)))))))))))))(((.(((((...)))))))).....))))))...)).))).)))....))))))))))).)))))).)))).)))))...)))))))))........(((((......))))).......((((((.......))))))))))..)))).)))))))))))))))))))))))))).)))))).....)))).))))..........))))))).....))))).))))).)))))))).)).)).)))))..)))))...))..)))))..(((((((((........))))))))).....(..((((((...))))))..)..............)))))))))))(((((((....(.((((....)))))....))))))))))))))..)))))).)....)).))...))))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((((((((((((((((((...(((((((((((.((((.((((((((.........,))))))))))))..))))((((..(((((.(((.((...(((((....)})})).)).))).))))).)))).)).))))).))))))).(((((((.(......((((((((.((......)).))))))))}.))))))).((((((.(((...))))))))).((((....))))((((((((((((({.(((((((.,..{.{{((((((.({{((({.,,,.((({(((.((((({...(((((((((((((((..{{....(((((((......{{(((,((...(((((((.((.((((((..,.({..((((.(((((.(((((.((((((((((.(((.....(((.(((((({{((((((((((((,((((((.(((.((((..((((((....))))))..)))).))){{||,..{.((((((((....)))))))).)..||}}.{{.{||,..)))}))..}}}}||||,,,,(((((((.(((((....)))......)).)))))))}}}}.||||,{{{((({....}))),,,,.((((((((,(({(..,..((((..(((...((.(((..((((((((((((((.(((.((....)).))).))))).))|((((....)))),...(((((......))))).{{,......})})))))).))).)).)))..))))..,)))))))}})))).{{{{{(....))}}}),..(((.((((((({.......{((((({...)))))))))))))).))).....))))).}}.)))))).))).(((.(((((({(,..(.((((.((((((((...))))))...)).))))},.))))))))...)))..(((((((((((((((((((((.((.((((....)))).)).)).))))))))..))))))),})))((((({...|))))},.......}}}.})),,..))))))),)).))}.(((.(((((.{,.((({.....}))),))))).))).,,..))))).)))).,)})))))).)).)))))))}).)}))),..,.)))).))}....))..))))))))).))))))))))),)))))))))))),)}||(((((.{{.(((({.{{({..({.(({({(((.,.{{{{...({{(((({(((({,,{,{(((((((({{(({{{{{,|(.(((({{{(,({{{{{,}}||..||||||{{((((((..,...((((.((((..(((....((((...}}}}......))).)))).))))...,..)))))}.{{((((...,,...,,,,,},,.))))))))}}{|||,{||,,}|{|||||.{(,{,.,((({..,((((((.,((((.,{|||||(((((...((((({...,,((((.((........)).)))))))))))))))}..))),))),))),},},)})}},)))}..((((.((......)).)))){{((((.....})))))|((({{{{{|||.((((((((((.,.{((((.(({...})).))))).)))).)))))).....|||,,...(((({,.|.||||,,,{{{.(({((((((.((....,..))((({((.,.)))))){(({{...({{...{,{{|..{{{....,{(((...)))}|{{{{,..{{((((..,((({{(((((,..,.{{{..{|||||||{|||{(({({{((,(({(..(((({(.(((,,{,..,)},,))))))))).....,||||||.}|,|,,|||}|||}|}}||}},,||}||},,}}}}}|||{||||{||||{{||||,....||,(({{{{{.{{,||,..,{,||,..}}}||||,{|||||||}|||||,||||||||||{..,,}|||||,..}}}))||||{||.{{{...}}))))))))},,,.{{{{{{{{.|||.}||||||.||||||.,{||,,......)}),.((((((((((...))))))))),.{((((({..,(({..,..((.((.((((((((((((.(((((((((({(((((((((({.{,((({........}}||{.(((((((.(({.,(((({{{({{((({{{,...||}}|}.}},)})}..,|||,{|.{{|..,))))}..|||(((....)))))).))).))))}}}..{(((((......)))))|((((.........)))))}))},,,)}..,)))))}}}})...(((.((((((.((.,,..,)}}},.)))))).)))...,..............}))))))))).))))))).......))))).)).))..)}}..)))))))}.}}}}}}}))))|,}})})}|}}||.}}})))}.),,,)}}.}))),,,,,,.)})))))|||||||||.|||||||,||.||}.....(((((((.(((...)))}))))))....{{{((({...},,.,}}...,,..,}}}||||}}}|(((((((((...........)))))))))}}}}}....{{{{((((.(((((((........))))))).(((((((((((((((..{{.(((((.((...)).))))).}}..((((((((((...))))))))))(((((,..(({{......}),}}))))).(((((((.((((...{({.,(((((((({.{((.....)))))))))))}.((((((..(((((((((....))).,{{{{...,||}.,....{{{((,(({.,((({...{||||,,,....,(((((({(.({.((,(.((,,..||.}}}},})}.))))}))))})).)})),))})}}))))))))))))))..))....))))))))))).)))))))).)))))))...{{{,(({{{{(.({(((,{{{....,,,,............,..{|||{{{..,..,{{{{||,||||||.|{|}}}},,|}}}..,|,,}}||||}}|||}|||||...,}},|}{|||{{(((({.{{.{{{{|||((((.,,,,.,..{{{{.{{{{|....))))))))),,))))).})))}}.}}.,||||{{((.{(((,.{{{......)))}}))}.)))))))).||)}.},)))))})}.))}.)))))))))))}},|((((((....))))))|(((((((((((((((((((.....(({{((((.{(((((((.((((..((((((.....))))))))))))))))).....}.)))))))..((((..((((...(((((((((((((((((((((((.,.(((((...{(((,....,)))}{{.(((((((((((......(({.{{{,..,,,.,,,((((.((((((.((....)).)))..))).))))}))))}..,},.))))))))))).,|(((({{((,,,(((.....,,,|||.....,)),.....((((.((((((,.....,)))))))))).(((((...........))))).}}}}})))))))}{{{(((((...)))))),..)))))}.)))))))))....))))))},.,))).)))..)))))))).....)))))))))},)))))))))}{{{{...({((,({{{.,,,)))).,,||||,,.}}|}}}|}|||||.}}|||||}}}...}}|||}}.,}}))},},))))}}.)},,..,)).||||}}|||||||.,.}}||||||,.||...|||,|||||{}}}})))}...((((((...)))))).||||||((((,,,((,{....,,,))))||{|||{{{((({{.....|||},.(((((((.(({{,{{{{,{{.{{||{..,,.)}}}|,,..,|||||||,}.|||||||}}}..{(((({{{||}|{{{.{{||,,,,,..,)))),)),,....|,}|||}....)))||,{{|||,||,|||,,.)))))))))},,....,)))))),)}))....))},,}}}},),}})))),)})))))))))..,,.))))))))..)))))..))))))).)))))))))...,(.(((.((((((((...((((...,,((((((..(((((((..{{{,.,,.(((({({...,,|{{{,.((.((((.(((...))).)))).))(((((((...(((((....(((((.(({(.((((((((..(((((((((((((((((((((.((((...(((((((((((((((,.,(.({(((,,,,|||||.,...,)}}.((((((.....)))))|,..((((((((((({......})))))...((((.......))))...))))))..),}))|))||....}.}}},.,,,,,,..((((((((((,,(((((.((((.(((..((..((((.((((((((((((........)))))))(((.(((((((..(((((((((((.....)))))).,{{{.,....}}}},)))))..))))))).))).))))).)))).))..)))...{(((..((({...{{((((...}}}}(((((((((...(((((..(,,((((((((.(((((((((.((...((((..,((({.,((((.((((..(((((.((((((...({((((((((((.....(((({({....{(.((({{(,(((..(((((((((((..{....)..))))))))))).))),{|{{{(,,{,|(((((|{|((|{,{(,{|,...{(({((({(,,{((((.{{.,((({{.{|||||||,|||,,,..,,)}),))}))))}))))),,)),))}})}}.,)),}}|((((((...((((((.{{((,((((,(....}.,}}.|,))))}}}}}}......)))))))}||||||||,{{|{|}|}|||}}}{{((((((({...)))))))},)},}}))).,}))))))),,,)))))))))|{((({....}}}.})}..,((((({{(((((((....(((((.......(((((...(((.(((((((((((.((((((({.((.((((.{{{((((((..(....}}..))))||{{{.....)))),))))))}))))))).))))))).))))((((((((.((((((.....)))))).)))..((({....)))((((({........))))))((((.((((..,{,((((((.(((((((..(({(((((((.((.((((((((.(((....))).)))},)},)).))..))))))).))}.)))))))))))))...((((((((((........))))))))))..((((..(((((((,({......)))))))))..))))...,.)))))).)))).......)))))..)))..)))))..))))).))))))))))))).}..}}}.)))))).))},))..)))))))))).))...)))).....))))))))))).)))))).)))).)))))...)))))))))..,.,,..(((((......))))).......((((((.......))))))))))..)))).))))))))))))))))))))))))))}}))))).....)))).))))..........))))))).....)))))},)))).)))))))).}}.)).)))))..))))).,.}),,))))}..(((((((((........))))))))).,,,.(..((((((...))))))..}...,,}.,.,,,..})},))))))){{{{{{{.....{((((....)))))....))})))))))))))..)))))).)....)).))...))))))))))).),

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015692.5 NCBI
AGCUUGGCCGGGCGCGGAGCGGGGCGCAUGGCGCCGGGCGCACUGCGCG… 5983 nt 0.6156
Summary

This gene encodes a member of the protease inhibitor I39 (alpha-2-macroglobulin) family of proteins. These proteins are important in innate and acquired immunity. The encoded protein is membrane-associated and proteolytically processed to generate two chains. Mutations in this gene cause a form of anterior segment dysgenesis, a developmental disorder of the eye. [provided by RefSeq, May 2017]

Forensic Context

A study in the flesh fly *Sarcophaga peregrina* demonstrated that the CPAMD8 is a differentially expressed gene whose expression increases during pupal development at 25°C and can be used for precise age estimation during the intrapuparial period [Shang et al. DOI:10.1007/s00414-022-02934-7]. A review of transcriptomics in forensic entomology further notes that the CPAMD8 is a differentially expressed gene identified during the intra-puparial stage of *Sarcophaga peregrina* for age estimation [Mei et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2026.102801].