Basic Information

Symbol
ADGRB1
RNA class
mRNA
Alias
Adhesion G Protein-Coupled Receptor B1 Brain-Specific Angiogenesis Inhibitor 1 BAI1 GDAIF
Location (GRCh38)
8:142449430-142545009
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001702.3
Sequence length
6020.0 nt
GC content
0.6847

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2955.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3043.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1326.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001391985.1 NCBI
GAGAAGAGCCGGGCAGGCGAGAGGAGCGGAGCGGCGGCGGCGGCCGGAG… 6011 nt 0.6844
NM_001391986.1 NCBI
GAGAAGAGCCGGGCAGGCGAGAGGAGCGGAGCGGCGGCGGCGGCCGGAG… 6002 nt 0.6854
NM_001702.3 NCBI
GAGAAGAGCCGGGCAGGCGAGAGGAGCGGAGCGGCGGCGGCGGCCGGAG… 6020 nt 0.6847
Summary

Angiogenesis is controlled by a local balance between stimulators and inhibitors of new vessel growth and is suppressed under normal physiologic conditions. Angiogenesis has been shown to be essential for growth and metastasis of solid tumors. In order to obtain blood supply for their growth, tumor cells are potently angiogenic and attract new vessels as results of increased secretion of inducers and decreased production of endogenous negative regulators. BAI1 contains at least one 'functional' p53-binding site within an intron, and its expression has been shown to be induced by wildtype p53. There are two other brain-specific angiogenesis inhibitor genes, designated BAI2 and BAI3 which along with BAI1 have similar tissue specificities and structures, however only BAI1 is transcriptionally regulated by p53. BAI1 is postulated to be a member of the secretin receptor family, an inhibitor of angiogenesis and a growth suppressor of glioblastomas [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the ADGRB1 (Bai1) mRNA was upregulated at 2 hours, persisting through 72 hours after a 5 psi blast exposure, and was elevated at all time points in higher exposure groups, identifying it as an angiostasis/angiogenesis inhibition marker responsive to blast intensity and time [Balaban et al. DOI:10.1016/j.jneumeth.2016.02.001].