Basic Information

Symbol
CPD
RNA class
mRNA
Alias
Carboxypeptidase D Metallocarboxypeptidase D GP180 EC 3.4.17.22 EC 3.4.17 Gp180
Location (GRCh38)
17:30378922-30469989
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001304.5
Sequence length
9372.0 nt
GC content
0.4056

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2602.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2800.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2646.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199775.1 NCBI
AUUUGUGCACCUUAUUAGCCUGGGCAGAAUGGCUAAUGGUCACACUUCU… 8422 nt 0.3768
NM_001304.5 NCBI
GCCCGGAGCGCUGAGCCGCGGGAGCGGAGCCGGGGUUAGCGGCGCUGCU… 9372 nt 0.4056
Summary

The metallocarboxypeptidase family of enzymes is divided into 2 subfamilies based on sequence similarities. The pancreatic carboxypeptidase-like and the regulatory B-type carboxypeptidase subfamilies. Carboxypeptidase D has been identified as a regulatory B-type carboxypeptidase. CPD is a homolog of duck gp180, a hepatitis B virus-binding protein. Transcript variants utilizing alternative polyadenylation signals exist for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.