Basic Information

Symbol
CPEB1
RNA class
mRNA
Alias
Cytoplasmic Polyadenylation Element Binding Protein 1 CPEB Cytoplasmic Polyadenylation Element-Binding Protein 1 CPE-Binding Protein 1 FLJ13203 CPE-BP1 HCPEB-1 H-CPEB CPEB-1
Location (GRCh38)
15:82543201-82648861
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001365242.1
Sequence length
3482.0 nt
GC content
0.4891

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1161.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1230.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 906.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001365245.1 NCBI
CCCUCCGGCGGUAUCAGGUCGCAUCAUCCUCAGUCCUGGUCAGAGGGAG… 3419 nt 0.4914
NM_001365246.1 NCBI
CCCUCCGGCGGUAUCAGGUCGCAUCAUCCUCAGUCCUGGUCAGAGGGAG… 3447 nt 0.4903
NM_001365247.1 NCBI
GGCCGGUGGGGCCUCCGAGCCGCACUGCGGCCUCCAGGCGGCCUCGAGC… 3234 nt 0.4901
NM_001365248.1 NCBI
AGUCGGCUGCUUUGGCUCUGCUGUCGGCGGAGAGGACUUCAGUCGUGCG… 3052 nt 0.4879
NM_001365249.1 NCBI
AGUCUGUAAUGCAGACGGGAUAGGGACUUCCAGGACUCUGAAGAAACAG… 2912 nt 0.4815
NM_001365250.1 NCBI
AGUCGGCUGCUUUGGCUCUGCUGUCGGCGGAGAGGACUUCAGUCGUGCG… 3067 nt 0.4871
NM_001387061.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3605 nt 0.4877
NM_001387062.1 NCBI
CCCUCCGGCGGUAUCAGGUCGCAUCAUCCUCAGUCCUGGUCAGAGGGAG… 3831 nt 0.4944
NM_001387063.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3532 nt 0.4875
NM_001387064.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3590 nt 0.4883
Showing 11 to 20 of 35 entries
Summary

This gene encodes a member of the cytoplasmic polyadenylation element binding protein family. This highly conserved protein binds to a specific RNA sequence, called the cytoplasmic polyadenylation element, found in the 3' untranslated region of some mRNAs. The encoded protein functions in both the cytoplasm and the nucleus. It is involved in the regulation of mRNA translation, as well as processing of the 3' untranslated region, and may play a role in cell proliferation and tumorigenesis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the protein Cpeb3, a potential target of the CPEB1, is involved in methamphetamine-induced behavioral sensitization within the nucleus accumbens [Li et al. DOI:10.1111/adb.12881].