Basic Information

Symbol
CPEB1
RNA class
mRNA
Alias
Cytoplasmic Polyadenylation Element Binding Protein 1 CPEB Cytoplasmic Polyadenylation Element-Binding Protein 1 CPE-Binding Protein 1 FLJ13203 CPE-BP1 HCPEB-1 H-CPEB CPEB-1
Location (GRCh38)
15:82543201-82648861
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001365242.1
Sequence length
3482.0 nt
GC content
0.4891

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1161.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1230.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 906.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001387065.1 NCBI
GGCCGGUGGGGCCUCCGAGCCGCACUGCGGCCUCCAGGCGGCCUCGAGC… 3427 nt 0.4856
NM_001387066.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3749 nt 0.4868
NM_001387067.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3691 nt 0.4860
NM_001387068.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3304 nt 0.4930
NM_001387069.1 NCBI
CCCUCCGGCGGUAUCAGGUCGCAUCAUCCUCAGUCCUGGUCAGAGGGAG… 3696 nt 0.4995
NM_001387070.1 NCBI
ACAGGUGCUCCGCAUCCGGCCGGGGGGCGGCUCCGAGGAGCGGCUCGUA… 3315 nt 0.4944
NM_001387071.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3339 nt 0.4921
NM_001387072.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3574 nt 0.4877
NM_001387073.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3618 nt 0.4854
NM_001387074.1 NCBI
GUGCUCUGUGGAGAGCCCCACGACGGCGGCGGUCGCGGCACCUUUAAGG… 3275 nt 0.4892
Showing 21 to 30 of 35 entries
Summary

This gene encodes a member of the cytoplasmic polyadenylation element binding protein family. This highly conserved protein binds to a specific RNA sequence, called the cytoplasmic polyadenylation element, found in the 3' untranslated region of some mRNAs. The encoded protein functions in both the cytoplasm and the nucleus. It is involved in the regulation of mRNA translation, as well as processing of the 3' untranslated region, and may play a role in cell proliferation and tumorigenesis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the protein Cpeb3, a potential target of the CPEB1, is involved in methamphetamine-induced behavioral sensitization within the nucleus accumbens [Li et al. DOI:10.1111/adb.12881].