Basic Information

Symbol
CPEB3
RNA class
mRNA
Alias
Cytoplasmic Polyadenylation Element Binding Protein 3 KIAA0940 Cytoplasmic Polyadenylation Element-Binding Protein 3 CPE-Binding Protein 3 CPE-BP3 HCPEB-3
Location (GRCh38)
10:92046692-92291628
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014912.5
Sequence length
7781.0 nt
GC content
0.4214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2211.97 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2368.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2397.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001178137.2 NCBI
ACAGUUGUCAAAGUGCUUUUGCCAGAGCGGUCACAUAAUCAACCUGAAA… 7697 nt 0.4148
NM_014912.5 NCBI
AGAGGCUGCACAGCCCGCCCGGACCAACGCCUCCGCGCCUGCCGCCGUC… 7781 nt 0.4214
Summary

Enables mRNA 3'-UTR binding activity and translation factor activity, RNA binding. Involved in cellular response to amino acid stimulus and regulation of gene expression. Located in several cellular components, including cytosol; midbody; and nucleoplasm. Part of CCR4-NOT complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the protein Cpeb3, a potential target of miR-128, is involved in methamphetamine-induced behavioral sensitization in the nucleus accumbens [Li et al. DOI:10.1111/adb.12881].