Basic Information

Symbol
CPT2
RNA class
mRNA
Alias
Carnitine Palmitoyltransferase 2 Carnitine Palmitoyltransferase II CPTASE CPT1 Carnitine O-Palmitoyltransferase 2, Mitochondrial EC 2.3.1.21 CPT II Testicular Secretory Protein Li 13 IIAE4
Location (GRCh38)
1:53196792-53214197
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000098.3
Sequence length
2699.0 nt
GC content
0.5154

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-964.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1012.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 797.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000098.3 NCBI
GGAGAAGUGCCUCAGGAGUCCUGACGCAGUGUCUUGGGCGCUAACGGCG… 2699 nt 0.5154
NM_001330589.2 NCBI
GGAGAAGUGCCUCAGGAGUCCUGACGCAGUGUCUUGGGCGCUAACGGCG… 2630 nt 0.5152
Summary

The protein encoded by this gene is a nuclear protein which is transported to the mitochondrial inner membrane. Together with carnitine palmitoyltransferase I, the encoded protein oxidizes long-chain fatty acids in the mitochondria. Defects in this gene are associated with mitochondrial long-chain fatty-acid (LCFA) oxidation disorders. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.