Basic Information

Symbol
CPVL
RNA class
mRNA
Alias
Carboxypeptidase Vitellogenic Like Vitellogenic Carboxypeptidase-Like Protein Probable Serine Carboxypeptidase CPVL Carboxypeptidase, Vitellogenic-Like CP-Mac Carboxypeptidase Carboxypeptidase WUG VCP-Like Protein HVLP Putative Serine Carboxypeptidase CPVL EC 3.4.16.- EC 3.4.16 VLP
Location (GRCh38)
7:28994636-29195451
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_031311.5
Sequence length
2087.0 nt
GC content
0.4197

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-595.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -637.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 475.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((.(((.((.((.(((((.(((((.(((.(..((((.((((((((..((....)).))))))))))))).))).))))).)))))....))..))))).))))).(((((.((..((((.(((.(.(((((.(..(((((.(((.((((.(((((...((((((((((.((...((((((((.(((((((........(((....)))........)))))).)...))))))))...................(((..(((((((((((.(((...((((((((...((((...(((((((..........((((..........))))..)))))))..))))..((((.......)))).........)))))))).))).)))))))))))..)))..(((((((.(((((....)))..))))))))).)).)).)))))))).((((((........)))))).(((((((((((((.....)))))).)))))))))))).))))..))).))))).).)))))).)))))))...)))))))(((..(((.(((((((.((((.(((((......(.(((((...))))).)...))))))))).....))))))).)))..)))..((((.(........).)))).((.(((((((.(((((((((((((.....((((((((........))))))))((.(((((((((((.(((((((.......((((((((((((..((((((.(((((............))).)))))))).((((((((((((.((((((..(((((...)))))..)))))).)).....((((((((((.(..(((((((.................(((((((((...((.((((...........))))))..))))).))))....)))))))..).(((((..(((.......(((((((..((.(((..((.((((........))))))..)))......(((((((((((.....((((....(((...(((.((((((....)))))).)))...)))......))))...)))))))).)))..(((((((.....((((((.(.((....)).).)))))).....)))))))))..))))))))))..)))))...))))))))))...(((((..(.....)....)))))..((((((((.(...).)))))))).................))))..)))))).)))))))................)))))....))))).))))).)))))))).))((((((..((((........))))............(((((.........(((..((((......))))..)))...((.(((((((((((((((.....)))))).((((((((..(........)..))))))))...............))))))))).))((((((((((((..((.........(((.(((.(((..((((.(((.((((.......))))...))))))).))).))).))))))))))))))))).....((((((((.((((.((...(((.....)))..)).)).........)).))))))))..)))))..(((..((((........))))..)))((((...)))).(((((((((((.((((.((((((((((((((((........((((....))))....((..((((((((((((((((..........)))).))))))))))))..))....((((((...((((......))))..))))))....(((((.........)))))....)).)))))....(((((((...........))))))))))))))...)).)))).)))))))))))..))))))....)))))))))))))....))))))).)).((((((...((((((.........)))))))))))).(((..((((((((.....))))))))..)))..))))........((((....))))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((.(((.((.{(.(((((.(((((.(((.(..((((.((((((((..((....)).))))))))))))).))).))))).)))))....)}..))))).))))).(((((.,,,,((((.(((.(.(((((.{..(((((.(((.((((.(((((...((((((((..((((({((((((((.{((((((.....,..(((....)))..,.....)))))).}...))))))))))))}....,{{((.....,{({.(((((((((((.(((...((((((((...{(,(,,,((((((,.,,.....,,)}}}}},}.,|,{|,,{{,,}||||,,..,,,,}}|,|,,,,,..})),).........)))))))).))).)))))))))))}}},,..(((((((.(((((....))}.,)})))))))..,)))})))))))).((((((........)))))}.{((((((((((((,...,)))))).))))))}))))).))))..))).))))).,.)))))).))))))),..},)))))(((..(({.(((((((.((((.(((((......,.(((((...))))).)...))))))))).....))))))).))}..)))..((((.(........).)))).{{.{{{{{{{.{{((((((((((((({{,{(({{{{{.....,,,}}}}}})))}..|||((((((..{(((({(((((((((((((((((({.(((..((((((((,.{,{{{{.{{{{{{||,.{((((........)))){{.((((((..(((((...)))))..)))))).}|,,....,..}}}}}))){{{{{((({(.....))))}||,...|}|||,,.}}}}}}}|,,.,....,,,({,((((({{,.(((((((((((({((,,(((..{,,(((({.........}}|||,||,{{((.(((..,,.((((.....,,,|}}|||,{|.,......{{|(((((({{,....{(((.,..{((...(((.((((((....}))))).)}}.,,)}},,.,..)))}...)))))))},}}|,.({{{{{{.....,(((((.(.((....)).).)))))),,,,,})}))))}}..})}}}}||||,,|||||...|}}}.})},,...|||||,|}...,,).,,,))))}..((((((((.(...).))))))))..,,,.,,.,..,,,,..}}))))}))},.))}.)))),.}))}.))},.}))))))|,}})),{{...,|.}||||{|,},,.)))},}},.{{|{...,,...))))...........,,,,,.........}}||,,|}|,}))}...}}}..,.))).})))))))))..((((((.....)))))).((((((((..(........)..)))))))))))))))))..(((((((({(((,,,(((({{(((((({.,(({........,||,|{{.{((..{(((.(((.((((.......))))...))))))).))).))).},,,.)))))))))}}}}..}})),........{{,,....,,.,,....))))))))...............,,,.....})))))))))))}||{{{...{{{,...,},}.,,||},.,},|,{((((((((((.((((.(((((((((({(((,,.,,,,,..(((,.,{,|||}.,,.{{..((((((((((((((((..........)))).))))))))))))..}}....|{{{||,|,|{{|},..,,)))},.}|||||...{((((({....}}))))),},,}},}.,}}},....((((((({{.....}},.}))))))))))))}..})).)))).))))))))))),|}.,|||.....)))))))))))),}},,})))),.}}.((((((...((((((.........)))))))))))).{((..((((((((.....))))))))..)))..))))..,.....{{{{....))}},...,,..................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001371264.1 NCBI
GCUUUUCGCUCGCUGCACUCCAAGCCCCGGAACACCCGCGUCCGCACAC… 3162 nt 0.4184
NM_001371265.1 NCBI
GCUUUUCGCUCGCUGCACUCCAAGCCCCGGAACACCCGCGUCCGCACAC… 3380 nt 0.4237
NM_001371266.1 NCBI
GCUUUUCGCUCGCUGCACUCCAAGCCCCGGAACACCCGCGUCCGCACAC… 3248 nt 0.4190
NM_001371267.1 NCBI
GUGCACAGACGGCCCAGGAUGGGUUAAUGAGCAGGCAGCUCAGACGCCG… 3219 nt 0.4160
NM_001371268.1 NCBI
GCUUUUCGCUCGCUGCACUCCAAGCCCCGGAACACCCGCGUCCGCACAC… 2418 nt 0.4032
NM_019029.3 NCBI
GUGACUGGGUGGGGCUGCCUCACUUCUGCCUGAUUUGGGAAGCGCUGCA… 2179 nt 0.4314
NM_031311.5 NCBI
GUGACUGGGUGGGGCUGCCUCACUUCUGCCUGAUUUGGGAAGCGCUGCA… 2087 nt 0.4197
Showing 11 to 17 of 17 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a carboxypeptidase and bears strong sequence similarity to serine carboxypeptidases. Carboxypeptidases are a large class of proteases that act to cleave a single amino acid from the carboxy termini of proteins or peptides. The exact function of this protein, however, has not been determined. [provided by RefSeq, Jan 2017]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CPVL was identified as a hub gene in the WTAP-associated co-expression module and its higher expression was associated with a lower overall survival rate in human sepsis patients [Zhang et al. DOI:10.1186/s41065-025-00480-x].