Basic Information

Symbol
CPXM1
RNA class
mRNA
Alias
Carboxypeptidase X, M14 Family Member 1 CPX1 CPXM Carboxypeptidase X (M14 Family), Member 1 Carboxypeptidase-Like Protein X1 Metallocarboxypeptidase CPX-1 Probable Carboxypeptidase X1 CPX-1 EC 3.4.17.10 EC 3.4.17.- EC 3.4.17.3 EC 3.4.17
Location (GRCh38)
20:2794069-2800658
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_019609.5
Sequence length
2376.0 nt
GC content
0.6052

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-976.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1013.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 558.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001184699.2 NCBI
GAGACCGACCCGCCACCCGCCGUAGCCCGCGCGCCCCUGGCACUCAAUC… 2154 nt 0.6026
NM_019609.5 NCBI
GAGACCGACCCGCCACCCGCCGUAGCCCGCGCGCCCCUGGCACUCAAUC… 2376 nt 0.6052
Summary

This gene likely encodes a member of the carboxypeptidase family of proteins. Cloning of a comparable locus in mouse indicates that the encoded protein contains a discoidin domain and a carboxypeptidase domain, but the protein appears to lack residues necessary for carboxypeptidase activity.[provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CPXM1 was upregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term (0-5 month) weight loss in obese participants, and this expression pattern was reciprocal to that observed in acquired obesity within BMI-discordant monozygotic twin pairs [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].