Basic Information

Symbol
CR2
RNA class
mRNA
Alias
Complement C3d Receptor 2 C3DR CD21 Complement Component (3d/Epstein Barr Virus) Receptor 2 Complement Component 3d Receptor 2 Epstein-Barr Virus Receptor Complement Receptor Type 2 EBV Receptor Complement C3d Receptor CD21 Antigen CVID7 SLEB9 Cr2 CR
Location (GRCh38)
1:207453024-207489895
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001006658.3
Sequence length
4139.0 nt
GC content
0.4530

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1228.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1311.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1408.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001006658.3 NCBI
AGCUGCUUGCUGCUCCAGCCUUGCCCUCCCAGAGCUGCCGGACGCUCGC… 4139 nt 0.4530
NM_001877.5 NCBI
AGCUGCUUGCUGCUCCAGCCUUGCCCUCCCAGAGCUGCCGGACGCUCGC… 3962 nt 0.4505
Summary

This gene encodes a membrane protein, which functions as a receptor for Epstein-Barr virus (EBV) binding on B and T lymphocytes. Genetic variations in this gene are associated with susceptibility to systemic lupus erythematosus type 9 (SLEB9). Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that burn injury to the hind paw induced significant transcriptomic alterations in the primary somatosensory cortex (S1), where the protein calretinin, an interneuron subtype marker, showed significantly increased colocalization with the neuronal activation marker c-Fos in the contralateral S1 cortex following the injury [Erdei et al. DOI:10.3390/ijms26083538].