Basic Information

Symbol
CRCT1
RNA class
mRNA
Alias
Cysteine Rich C-Terminal 1 C1orf42 NICE-1 Cysteine-Rich C-Terminal Protein 1 Protein NICE-1 NICE1 Chromosome 1 Open Reading Frame 42 Cysteine-Rich C-Terminal 1
Location (GRCh38)
1:152514482-152516008
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_019060.3
Sequence length
718.0 nt
GC content
0.6253

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-293.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -304.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 142.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((...))).))))....((((((..(((((((...((((((((((..(((((...((((((((((..((((.(((((..((...))..))))).)(((((((.(..(((((.(((((((((..((((..(((((...(((.((((((.(((((((((........((((((......)))))).((..((..((.((((.((((((((...(((.((((((((.(((((.......))))).))))))))..((((....(..((....))..)....))))..))))))).)))))))).)).))..)).(((((.((((((.((((((((.(((((((..(.(((((.......))))).).))))....))).))))))))...(((((((........(.((((.((...........)).)))))....)))))))..)))))).)))))....))))))))).)))))).)).)...))))).....).)))..)).)))))..))...))))).).))))))).....(((((((...(((.(.(((((((..(.((....)).)..))))).)).).)))...))))))))))))))))))))....)))))..(.((((((.....)))))).).((((((((........))))).)))......)))))).))))......).)))).))..))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((...)))}})))....,(((((..((((((,{(.(((((((({{{{(((((...((((((((({.,((({.(((((..((...))..))))).}(((((((.(..(((((,({(((((((..((({..(((((..,(({.((((((.(((((((((...,,...((((((......)))))).((..((..((.((((.((((((((..,(((.((((((((.(((((.......))))).)))))))).|(({{....|..|{.,,.))..}....)))).|}||))}).)))))))).|}.}}..)),{{{{(.{({|{|,{(((((((.(((((((..{.(((((.......))))).}.))))....))).))))))}).|.(((((((........|.((((.((..,........)).)))).,.}.))))))),.)))))).)))))....))))))))).)))))).)),}...))))).....).)))..)).))))).,),...))))).).))))))).....(((((((...(((.{.(((((((..(.((....)).)..))))).}).).)))...))))))))))))))))))))....)))))..(.((((((.....)))))).).{{{((({{,,,....,))}}}.}}},....,)))))).))))..,...).)))).))..))).)),

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_019060.3 NCBI
AAUCCACUGCCUAGCAGGUGGCCCAUUCCAGUUGGAGAACGUAGUGAGU… 718 nt 0.6253
Summary

No relevant information is available at the moment.

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CRCT1 exhibited a Gini impurity score of 0, being present in all pure vaginal fluid samples and in some mixtures containing vaginal fluid while being absent in mixtures without it, supporting its role as a discriminatory protein for body fluid classification [Shehata et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2025.103343].