Basic Information

Symbol
CREB1
RNA class
mRNA
Alias
CAMP Responsive Element Binding Protein 1 Cyclic AMP-Responsive Element-Binding Protein 1 CREB-1 Cyclic Adenosine 3',5'-Monophosphate Response Element-Binding Protein CREB Cyclic Adenosine 3',5'-Monophosphate Response Element Binding Protein CAMP-Responsive Element-Binding Protein 1 CAMP-Response Element-Binding Protein-1 Active Transcription Factor CREB Transactivator Protein CREB
Location (GRCh38)
2:207529737-207605988
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004379.5
Sequence length
10095.0 nt
GC content
0.3594

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2560.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2765.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2112.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320793.2 NCBI
AGUCGGCGGCGGCUGCUGCUGCCUGUGGCCCGGGCGGCUGGGAGAAGCG… 1164 nt 0.4459
NM_001371426.1 NCBI
AGUCGGCGGCGGCUGCUGCUGCCUGUGGCCCGGGCGGCUGGGAGAAGCG… 10021 nt 0.3570
NM_001371427.1 NCBI
AGUCGGCGGCGGCUGCUGCUGCCUGUGGCCCGGGCGGCUGGGAGAAGCG… 9979 nt 0.3567
NM_001371428.1 NCBI
AUACAUCAUACAGUAACACACUUAUGUGCACCAUUGGUGCUGAGCUGCU… 9934 nt 0.3543
NM_004379.5 NCBI
AGUCGGCGGCGGCUGCUGCUGCCUGUGGCCCGGGCGGCUGGGAGAAGCG… 10095 nt 0.3594
NM_134442.5 NCBI
AGUCGGCGGCGGCUGCUGCUGCCUGUGGCCCGGGCGGCUGGGAGAAGCG… 10137 nt 0.3596
Summary

This gene encodes a transcription factor that is a member of the leucine zipper family of DNA binding proteins. This protein binds as a homodimer to the cAMP -responsive element, an octameric palindrome. The protein is phosphorylated by several protein kinases, and induces transcription of genes in response to hormonal stimulation of the cAMP pathway. Alternate splicing of this gene results in several transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CREB1 (Camp) was the most significantly upregulated gene, showing a 16.4-fold increase in lung tissue following hypothermia-induced death, and was validated as a candidate forensic biomarker of hypothermia through qPCR and immunohistochemistry, which confirmed increased protein expression in the cytoplasm of alveolar cells [Takamiya et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2020.101789].