Basic Information

Symbol
CREB3L2
RNA class
mRNA
Alias
CAMP Responsive Element Binding Protein 3 Like 2 BBF2H7 BBF2 Human Homolog On Chromosome 7 TCAG_1951439 Cyclic AMP-Responsive Element-Binding Protein 3-Like Protein 2 CAMP-Responsive Element-Binding Protein 3-Like Protein 2 Basic Transcription Factor 2 B-ZIB Transcription Factor FUS/BBF2H7 Protein
Location (GRCh38)
7:137874979-138002086
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_194071.4
Sequence length
7441.0 nt
GC content
0.4819

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2381.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2522.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2162.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((.(((...))).))((((..((((((((..(.(((((((((((((.........)).)))))))..(((((((((((((((((.(((((((.....(((.((((...)))).)))...)))))))((((((.((((((((((.((((((....(((((.((((((((....)))))))).))))))))))).)))).)))..))).(((((((....).))))))((((....))))(((((..(((((((...........(((.(.((..........)).).)))((((((((((((.((.(((.((.((((((..(((..(((((........)))))..)))..)))))).)).))).))...(((((........))))).(((((((((((((..(((((.(((((((((((...(((.(((.....)))))).((((((((((((((.((.((............((((((.((((((.((......(((((((((..(((((......)))))..))))).......)))).......)).)))))).))))))....((((((...)))))))))).))))))))).).)))).....(((((..((((((.......))))))....))))).((((......))))....)))))........((.(((.....))).))..(((((((.((((((((.(((.((((..((((((.........................)))))).))))...((((((((((..((....))....))).)))))))((((((((.((...........((((......))))...(((((((((((...((((((((..(((((((((((((((((((((((((...(((........)))....)))).....)))).)).)))))))........(((((.......))))))))))))).........))))).)))((((.((((((.(((((((((....))))))....((((((.(((((......................))))).)))))).((((((((.....((((((.((((..((..((((.......))))(((((.(((.((.(((((((.(((...........)))(((.(((((((.(((((..((((........))))..)))))..))))))).))).((((....................))))............))))))).)).((((((((((((((.((......))..))))....)))))..)))))..))).))))).................)).))))))))))......)))).)))).((((......))))(((((((((((((.(((((.((((.(((((.((....))..))))))))))))))......))).)))))))))).(((((..(((.((((.(((((((.((.((((((.(..(((((((..(((((..((((((.(((....)))...)))))).......((((((......(((((..........((((...))))........))))).....)))))))))))...)))))).)..).))))))....((.(((.((....)).))))).)).))))))))))).)))..))))).........((((((..(((((..........)))))..)))))).))))))))).))))...))))))))))).)).))))))))..((((..((((.((((((.((.((((((...........(((((.(((((..((((..((.(((((((.((.((((((.(((((.((((.(.(((...))).))))).)))))..(((((((((((((((((((((((((((...((((.......))))..))).((((.......(((((.((((((.((((((((....(((((((.............................(((.((((((((((((((..((((((((..(((((((....)))))...))..))))))))...)))..)))))..)).)))))))((((..(((((((((((((((........(((....)))......)))).((((((((.........))))))))...)))))))))))....))))......)))))))..))))).)))....))))))..))))).......))))(((((........((......(((((((...))))))).......))))))).((((((((((.(((((......)))))..((((...)))).........(((((.((((((....)))))))))))((((.(((((((.((((....(.((.(((((((((.....))))))))).)).)...))))((((.............))))....(((((((((((((.((((......)))).((((((.....)).)))))))))))))))))........(((((((.((....))...)))))))))).))))))))..........((((....))))))))))))))))))))))....(((((...((((((.(((......(((.((((((((......(((((..........)))))................((((((.(((((((...((((((........(((((((........)))..)))).)))))).)))))))..))))))...)))))))))))))).)))..)))...))))).....(((((....))))).)))))))))))))))).........(((((((...(((........)))....)))))))((((....))))..)))).)).))..))))))).))..))))...))))))))))......((((.....)))).(((((...)))))......(((((((((.(((((((.....))))).))))))))))).(((((.....))))).....((((.((....))))))...)))))))).))))))....)))).))))......))))))))..))).)))))))((((((((..........)))))))).((((((....((((....))))...))))))..((((((((....)))))))).)))))).)))))...(((((((((.((..........((((....((((((((((...............)))))).))))...))))......((((((((((((((..(((((((((((((((.(.......)))))))))).))).))).))).......(((((...........))))))))))))))))(((((.......)))))..)).))))))))).........((.(((((((((.......))))))))).))..............))))))).))))))))))))))))))((((((.(((((.........(((.((..((...((.(((((((.(((((((((.(((((((.(((((........)))))..)))))...))))))))))).))))))).))....))..)).)))....(((((...((((...((((..((((((((..((((.((((((((((.....((((((.....((((((.(((((...(((..((((((((((.(((.(((..((((((..(((((.((((.((((...)))))))).)))))..))))...))..))).))).(((((((((...((((((..........))))))...))).))))))))).))))))).)))...))))).))))))..((((((.((((((...((((...((((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((..(((((.(......).))))).(((..(.........)..)))...)))))))))))...)))))....))))))))...)))..............((((....)))).)))))))).....(((((((..((((((.......((((..((.(.(((((...(((((((((((.((..(((.(........).))))))))))).....)))))...(((((.(((((((...(((((((........)))((((((((((((((((....(((..(((..(((....))).)))..)))..))))))))))))))))..))))))))))).))))).))))).)))..))))....(((.((((....))))))).)))))).))))))).............)))))))).))).......)))))))))..)))).(((((((....)))))))...)))))).))...((.((((((((.......((((((((((((((((.......))))))((((.......))))..((((((((...)).))))))...)))))..)))))....)))))))).)).))))((((...))))..............(((.((((((((......(((((.((........)).)))))((((.((((((((((...((((....(((..(((((((((((((((......)))))))).))).))))..)))....)))).)))))).)))).))))......................((.((((((((.(((.....)))...(((((.....)))))..((((((........))))))....((((((((.((((((.((((((......(((((((((((...(((((............)))))...))))))))))).........(((((((...............(((.(((((.(((((((((((.((((........))))(((((((..........((((.((.((((((....(((((.((..((((.(...(((((((((((....))))...)))))))..).))))...................((((((((((((..(((((((......))))))).((((.((((.........(((((((.((((((((..(((((....))))).......))))))))((..((.((.....(((((.(((.((..((((........)))).))..))).)))))))))..)).....)))))))......)))).))))......)))))))))))).((.(((...((((.((((......))))))))...))).)))))))))....)))))).)))))).)))))))(((((((......)))))))..........(((..(((.(((((..(..(((((((((((((.((((((((.((((((((....(((((((((((......(((((....))))).((..((((((((..(((((.......((((........))))..((((....)))))))))......((..((((.....((((........)))).......))))..))...))))))))..))....((((..............)))).)))))).............(((((((((....((.(((((((...)))...)))).))..))).))))))...)))))))))))))))))..))))..(((..(((..(((((.....)))))........((((.......))))((((....))))....(((((.(((.(....))))))))))))..))))))))))).......)))))..)..))))).))).))).)))))))))))))))).)))((((((.........)))))).....................))))))).(((.(((((((...........))))))).))).))))))....))))))...))))))))((((((((..(((((.............(((........)))..............)))))..)))))))).....)))))))).))................................)))))))))))..........))))))....)))))))))).)))).))))))))...)))).)))))))))..((((........))))............((((.((((....))))..)))))))))))))))...........(((((.((((((....(((....)))....))))))....))))))))))))....))))).........)))))))))))..)))))))))))).(.(((((....))))).)...............)))).)((((((............))))))......(((((((((((((((((..((....)).))))...)).)))..))))))))...((((((....))))))..(((((((((..............)))))))))((((((.(((((......))))).))))))((((((((....((((((..((((.............)))).))))))...))))))))..........((((((((..((((((.((((..(((...(((((.............((((.((.....((((((.((((.....(((((((.((((......((.(((....(.((((((......)))))).)....))).))...))))..))))))).......((((((..((((.((((((.((((((((((...(((.(((.(((((......((((.(((((..((..((((((.((..........))((((((((......(((.(.....).)))......)))))))).......))))))..))..)))))))))........))))).)))((((((...)))))).)))..)))).)))))).........(((((.....))))))))))).))))...))))))(((((....))))).............(((((.....))))).......(((((((.((...(((.((((..(....)..)))).)))))))))))))))).)))))).....((((....(((((((.(((((.............((.(((............))).))..))))).)))))))....)))).((((((.((..((((..((((((((((....)))))))..)))..)))))).)))))))))))).............)))))...))).)))).))))))...)).))))))............))))))))..)))).....((((..(((((((((((((.........(((((.(..((((....))))..).))))).............))))))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,{({.(((.,,|||{(((((,((((.(((((.((((.((((((((,((((...({{{{|||||{|||{{(({,,.{((({(((,{,((((((((.....(((.((({...}))).)))...)))))))),,,)}}((((((((((.((((((....(((((.((((((((....)))))))).))))))))))).)))).)))..))).{{((((((({.|{||,||{((({....})))}}},,..(({{.............,({{,({(,.....}))..))...,))||||}|}||||},||,|||,((.((((((..(((..(((((........)))))..)))..)))))).)).)))}))}}}}}.)))).}}}}.{({(((((,(((((((((({(((((,.(((((((,((({,.((,,(({..,,.|||||||((((((((((((((.{(,((.,{{(,{.,.,,((((((.(((((({((....,,((({(((((..(((({,...,,}})))..)))))......,)))).....,,),.)))))).))))))...,}))})}},..,}}}}},)).))))))))).)}})))...{{((((({.((((((.......)))))){{{.,,,))}((((......))))...................}))},||||...{((((({.((((((((((((({(...{(((..((((((...,.....................)))))).)))|({.((((((((((..{(,...))....))),})))))).}}}(((({,,{{.{{{{{...,,(({{{.,.|||,...(((((((((((...,(((((((..(((((((((((((((((((((((((...,{{........}},....)))).....))))},).))))))|........{{(((.......))))))))))))).........))))).)),((((.((((((.(((((((((....))))))..{{((((((.(((((...............,......})))).))))))}((((((((.....((((((.((((..,,,.((((.......))))(((((.(((,,((({(((((.,{{,,,,,,.....,,,(((.(((((((.(((((..((((........))))..)))))..))))))).))).((((....................)))).,,.......,,))))))}.)){((((((.....})))),))..{{,{.,{{{.....,)))),.}},))..))).))))).................)}.))))))))))......)))).)))).((((......))))(((((((((((((.(((((.((({{(((((.{{....}}..))))))))))))))......))).)))))))))).{{{{{,,(((.((({{(((((((.((.((((((.(...((((((..(((((..((((((.(((....)))...))))))}.|,..{((((.......))))}||,,.......(((,..{||},....}}....|||,...,,,}))))))))...))))))....,.))))))....{{.({(.{(....}},)))}}.)).))))))))))).))).,)||||,...,}}}}((((((..(((((.........,)))))..)))))).))))))))).))))...))))))))))).},,})})))))..,,||}}|||,{((((((.((,((,(({...,}},}}},{{{{{.{{{{,,,||||,}|.}||||||,.,|}|||{{{,{((((.((((.(.(((...))).))))).))))}..(((((((..,,,{{{,,,...,||,({{{..(((...(({{(((((.....))))))))...))),|,||{{||.,|||||||....,,,,,,.,}}.}}}}}............}}}}}}}}|||}|,||||((((({((..((((((({.,(((((((....)))))..,))..))))))))...)))..))))).})))))))),,||||}}|||||(((({,,,,|}}}({{{{((({{{.||{{{{{{{{{|{{((((((((.........))))))))...,,,,,,,}))).}}))))........,}))))},))}||{|||{{{{|,,,,)}})}}})||||..{(({((,{....,.....,,}},.}}{|||{({,,.}))))}}.....,,|||.,||{((((((((((.(({(({{{{.,|||||{{((((...}}||{.,,.....(((((.((((((....))))))))))),,(({(,{,,,,}|||,....|},|}|,|,,|||||}}}},))),,)))})).....},||((((.............}}}}....,{||((({{{{||}||||}}}}}}))))}|{{{||,.},,}}||}||||}||}}}})))}........(((((((.((....))...)))))))|||,|||||}}}..........((({....))))}}}}}}}|||.,,...,||||.,,,,,...|||||}}}||,.....{||.,|||||||}},...|||{{,,{..{{{{{||,||{{({........,..{((((,,.,|||||,{{{((((((,{{,,{,.,((((((,......,|||,,,}||,|||}||.}}||||||,}}||||.,,|||||}}|||||||.,|||||||{|,,||||.||{,(((((....))))}.,||,}||||||||||||{{{,...,(((((((,{.(((........))),},,)))))))|,{{{{..||||,.|,,,,||,|||,}}},}|},||,|}}})|,||}})}}},)}|}....((((.....)))).,||||,}}}},||||,,,,({{{{{(((.{{{((((.....))})),)}})||}}}}),}|{||||{..,.}})}},..,|||}||..,,}),)))},.,,,,,,,,.))))))..,,}}}},,,||,.,|,,,,,,,|||}|||.,},,.||{{((((((({..,......}))))))),|||,||,...((((....))))...,}}}},..((((((((....)))))))).,}|}}||}}},,.,{{{((({{{{.,,,...,,,{..{(((,..,(((({{{{{{.,,.,,,,....||,}||}||,}|||,,,}|}}......|{{{{{((((({{{,,{{(((,{((((((((.(.......)))))))))),})),.,|.||||{,,.,.{{{{{,}},,,,..,.)}}})))))))))}||{{({(,|...|,}}}}}}}}}|}}||}}}}}...,,....{|,|{|||{((({(({{{{||{||||||.,......{{{,,..,,,||{|{({{{{{(({{{,|.{{{{{,{,,((((((((({,.{{,..,({(,{,..,,...|||,.,|||{,(((((((((.(((((((.(((((........)))))..)))))...)}))))))))).,.|{(((,{,...,}},.,}.)||||...((((({,(..((((((.{,,{.({{{....))))......))))))..}))))))|},,..((((((.(((((...(((..((((((((((.(((.(((..((((((..(((((.((((.((((...)))))))).)))))..))))...))..))).))).(((((((((...((((((..,.....,.))))))...))),}))))))))}})))))).)))...))))).))))))......({.((((((.,.((((...((((((((((((.(((((((((((((((({((.((((((((((((((((((((((((..(((((.(......).))))).{{{..,.........}..}))...}))))))))))...)))))....))))))))...}}}..............,{,{....}}}}.)))))))).....(((((((..((((((....,,.((((..({.(.(((((,..(((((((((((.((..(((.,.,....,.,.))))))))))).....)))))...(((((.(((((((...(((((((,,......))){((((((((((((((({...,,|..,,,..|{({{{{|||.,,,,}))))}))))))))))))))))..})))))))))).))))).})))),)))..))}),.,.(((.((({....})))))).)))))).))))))).............)))))))).))).......)))))))))..)))).{((((({....})))))}...)))))).}},,,,{(((((((((...,,,..,,(((((((((((((...,...}}}}||{(((((((.((........)).))))))}(((((({...(((((....((((,.((((((((..((((({.((((((((((........)))))..))).))))))))..))))))))...((((...{{{(({.........})).}}}....))))......(((((({((((((((((((((......)))))))).))))},)}..........((((((((.((((.((((.((........)).))))))))..)))))))).,,.)))))).,((((({(((((.....))))}..{(((((........)))))}....,,,,.,,{,.(((((((.{{((..((({(((((((((((...(((((............)))))...))))))))))).......(((.{.....}}}.........,{,(({{....,,,,}}}}..},....}))),}}},))))))).,},}.,.}},|,,.((((.((.(,{((((((((((((.,,{{{.((.(((((((..((((.((.((.((..(((...(((((((((((........,..,{{(,((((((((((((((.{(({{......))))}|||,|,((((.((((...{{....(((((((,(((((((({.{{{((,,,.|||||,......,}))})))||}.||}||.}}}}|}}||.{.{((((((((.{{{{...})))...)}..})))))}.,.,,.........)))))))......)))),))))...}}})))))))))))}.}}.,.,.{{(((,.,,|}}}}.}}))))}),),,..,..))))}}))))))...)))...)).)).)).)))).)))))))..)).)))).)))))))))))))}.)).)))).,}})))))))))))..)))))))))))).,.((((((....||{,,{,((((({......(((((....)))))..|..,}}}))}{{{{{.({{,,{.,.))))),...,..,{|{{{(((({...|(||....}}}....,(,.(({{.....((((........))))...,,,.}}})..)).|.|(({(({(..,.....(({{.......,,.....}}}})))))))}|,,{,.......{{(((((({.,,|{{.||{((((,,,|,,...}}}}.))}}))),}|||||,....,}}})))))))))))))})}},}}||..{{||.(((((,....})))),,.||,|,{{||,.,,,..)))){{{{....))))...((((((.(((.{....})))))))))}}...)))))))))))))}},..,))))))))))))))))))),.}.)))))..},)))))}...,}}}|||}}}....|,,||,}|..,}.,,|||,{{{{{{.,{,|,,,,,{,{,{|(((,,{{,}||,...,,,))}}}||||||{{{|||||..,|||||,...,(((((..((((((((..(((((.............{{{........}}}..............)))))..))))))))..))))).,,.............................,.,......))),,,},,.,},||,.,,,.|{.|{{,||,},,,))}}}).))|}...)))}}...{{||,.((((.((((....))))))))}))))|||.,..,,,...,.}}}}.,......,)),}))),})))))})))),....,{{{{{(((((.((({{...((((((((.({...}).))))))))....}}...)).}.))})))))))}......(((,,...(((....))).,,,))).{,{({{{.,.,})))}.}.................})}}||||||}}}}}}}}}...,,}}}}....,,((((({{{{{{{{(({{..((,,,,|},|||}...}}||}}..}}}|||||...((((((....))))))..(((((((((.,,,.........,)}})))))|((((((.(((((......))))).)))))},,{{||||}||,{{||||,,||{{,,}|||,.,}}}}})))|)))))}.,,})))}))||,,,,.||||||||||{{||||{{{{,|||{,,|{....,{{({,{{,.{{,,,...|,,|,|}}}}}}||||||,|}},}},}}|||||||.||||...||,||,{{|....||((({((,..,..}}}}}}||,,|.|||.||{|{|}}}..,}|}|||{||{|{{.{,,{({...,..||{{.,.(((((((,,....,,,.}}}}}}},,.},,,,|||,,|}|||,}|}.}||||||.|{......}}},)}|{{{|||{......{{{,|,....}.)))......)))))))}.}}}}}}))),))}...))))))))),)}}})}.}}))))).,))},.|}}}}})),,...)))))))))}))))))......{(((((((.....))))))))..(((((((({{{{{,.(((((....))))).............(((((.....))))).,.,}}}}.)))))))).({((...,,)))).}}})}})))),,))))))))).)))),))))))......,{{{.,,.{{|||||,|||{{|||.....,,..,{|,(((,,...{{{{...,,,}))},))))).}}}))))....}})}.{{((({.,,.,(((({{((,(((((((....))))))),,))),.)))))}.}}}||{(((({.{,,{((({{....,,,,,,{{{|,.||,,..,,,}...,))}}},,.........,,}}})})).,.))))))),,,,,((((..(((((((((((((.........(((((.(..((((....))))..).))))).............))))))))))))))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001253775.2 NCBI
AGAGCCGAGGAGCCCUGGGGUCCCUCAAAGUUUGUGUCUGGAGCCGUAG… 1131 nt 0.5588
NM_001318246.2 NCBI
AGCGUUACCUGGGAGCUGAUGAAAAAUGCAGAAUCUCGGGCCUGCUUAG… 7043 nt 0.4715
NM_194071.4 NCBI
AGAGCCGAGGAGCCCUGGGGUCCCUCAAAGUUUGUGUCUGGAGCCGUAG… 7441 nt 0.4819
Summary

This gene encodes a member of the oasis bZIP transcription factor family. Members of this family can dimerize but form homodimers only. The encoded protein is a transcriptional activator. Translocations between this gene on chromosome 7 and the gene fused in sarcoma on chromosome 16 can be found in some tumors. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

A study in human umbilical vein endothelial cells demonstrated that ethanol exposure significantly downregulated the CREB3L2 mRNA, a key gene in the PI3K-Akt signaling pathway, with both 5-mM and 50-mM concentrations being effective [Liu et al. DOI:10.1002/Jat.4084]. Conversely, research in mice showed that chronic cocaine exposure and withdrawal induced a sustained increase in the CREB3L2 expression within the nucleus accumbens transcriptome [Eipper-Mains et al. DOI:10.1111/J.1601-183X.2012.00873.X].