Basic Information

Symbol
ADGRF5
RNA class
mRNA
Alias
Adhesion G Protein-Coupled Receptor F5 KIAA0758 GPR116 G-Protein Coupled Receptor 116 DKFZp564O1923 Probable G-Protein Coupled Receptor 116 G Protein-Coupled Receptor 116 Ig-Hepta Homolog KPG_001
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001098518.2
Sequence length
5761.0 nt
GC content
0.4381

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1682.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1789.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1379.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((..((...))..)))))).(((((((((((..((.((((((((..((.(((...(((((((((.((((((...(((((((((((((...........((((((((..(((((....((....(((((((((.......((......((((((....((((((......((((..(((((((((.(((((.((((((((...(((((..(((((((((((...(((((((((...(((((((((....((((..(((....((((((...(((((((((((((.(((((((.(..(((((...(......)...)))))..).))))).)).(((((.....)))))....))))))))))(((((((.(((((..((.((((((((.......((((((....((.....))...))))))...................(((((....(((((((....(.((((.....)))).)..)))))))...)))))...))))))))...))..))))).)).......................((((((.((((....((((((....))).)))....)))).))))))....)))))((....))......)))...))))))))).))))...)))))))))..........(((..((.(.(((((((((((((....((((((((((((((((.........)))))).....))))).......))))).....))))))))))))))))..)))((((((((..((.....)).))))))))(((((((.......((((((((.(((((.......((((......))))....(((((......)))))(((((((((..(.(((((((...(((((((.(((((.(((.((((.....((((((.(((..((((((((.((((.......)))).))))))))..)))..))))))(((....((((..(((((.((.((.((((.(((((((.......((.((........)).)).......((((((...............))))))...(((((((..(((((((((........((((..(.....)..)))))))))))))...))))))))))))))....)))).)))))))))..))))...))).....((((....))))....(((((((.(((............(((((((((((.....(((..(((((...((((((((((........(((((((...)))))))..)))))....)))))...)))))..))).......)))))...))))))..(((((..((((.((((.(((.(((((..(((((..(....)..)))))....).)))).)))..))))...)))).))))))))))))))).)))).))).)))))..)))))))...)))))))...((((((((((...............(((((((((((...)))...((((((...(((((((.((((..........(((((.((....(((((((((....))).)).))))..)).))))).....(((((.((.(((...((.(((((.((....)).))))).))..))).)).)))))......))))))))))).)))))).......(((((((..((.....))..)))).)))......((((((((.....((((.((.((((((((.((((((((((((.((((.((((..((((((..((((...((((((.........)))))).....(((((.....(((((((....(((........)))...)))))))))))).))))))))))................((((((((((((.........)).)).)))).)))).)))))))).))))((((((...(((........))))))))).))))))))......(((.(((((((((.....))))))))).)))))))))))..)).)))))))))))).(((((((.((......)).)))))))..))))))))....)))))))))).....((((((((...........((((.......))))...(((..((((((.....(((((((((((((.......(((..((.((((((..(((((((((.(((((((....((((((((((((.....)))).)..)))))))..((.((((((...............)))))).))......((((((..(((((((((.(..(((.........))).).)))))))))....((((((((...(((.......((((((((.(((.((..(((........)))..)))))))))))))((((((((((...(((...(((.(((((...........(((((...)))))......((((((.....))))))(((.((((((((((.......)).))).)))))))).....(((((....)))))....)))))..)))...))).)))))))))))))...))))))))................((.(((.......))).))....(((((.............((((((((.((((.....))))))....)))))))))))((((.....)))).))))))((((((((((.....(((..(((((........)))))..))).((((.....)))).))))))))))...((((...(((.((((((.((..(......)..))))))))..)))...)))).....))))))))))))...)))).))).))).))..))).......((((((((.((........))...))))))))((((((.(((((....(((((((...((((.((..........))))))...)))..)))))))))(((((............)))))....)))))).))))).)))))))).....))))))..)))....(((.(((((.....)))))..)))............((.....)).......)))))))).....)..))))))))).))))).)....))))))))))))))((((....(((((((((..(((((..(((((((((((((.....(((((.......((.(((((((.((((......(((((........)))))..)))).)))).))))))))))...))))))...)))))))..((((.(((((((....))))..)))...))))...........))))).)))))))))))))...))))).))))..))))))))))))))))....((((((((((((.(((((........)))))..)))).....)))))))))))).............)))).))))))))))))))......(((((......(((((....))))))))))......((((((((..(((.....)))..))))))))))))..))))))..)))))).......))(((((((((......)))))))))..)))))))))..)).)))))..))))))))((((((.....))))))))))))))...)))))...((((((.(((.........))).)))))).((((.((((((((((.........((....((((((....((((((((.(((...((((((..((.((((((((((.((..(((((((.(((((((((((.((((((...........)))))).(((((((.(((((((((........))))))))).)))))))...(((((....(((((((((((...))))........((.(((((((..........)))))))))......((((((...(((.((....)).)))))))))))))))))))))))))))))).........)).))))))).)))))))..((((........))))...............((.((((((((((.........(((.((((((((.((...)).)))))))))))..((((((((........))))))))......(((.((((((((.....(((((.((..(((((....((((........)))))))))..)).)))))(((((........)))))..........(((((....)))))(((((((...))))))).......))))..)))).))))))))))))).))........((.(((((.(((....))).)))))))))))).))...))).)))))).))))))))...))))))..)).........))))))........))))))))...)))))).)).)))))))(((((((((((.........((((.(((((((.....))))))))))).((((((....)))))).................(((((.((((((((((((((((.((..((((((....(((.(((((((........((((((((.((..(((.....)))....((((....(((((((....))))))).....)))).))...))))))))..)))))))))))))))).....((((((..(((......)))....))))))............((((......((((.....)))).....))))...)).)))......))))))).)))))).)))))((((((((((.((((.((((((...........................((((.((((((((((((....(((.....((((((.(((((((.............((((((((((((...(((((.........((((((((((.((((((((((((......(((.(((((.((.((((......))))))))))).)))(((((((....))))))).......((((((.........(((((((..(((((((..((.......(((..(((((((....)))))))..))).....)))))))))......)))))))......(((((((.....)))))))(((((((...((((..(((.(((..(((..((.((((......))).).))..)))...))).)))...))))...))))))).......))))))...)))))))...)))))..)))))).................((((........))))..)))))))))...)))))))))))).(((((...)))))..................(((((..((...((((((...))))))..(((((.....))))).((((((.((........)).)))))).))..)))))))))))).)))))))))))))))))))))))))((((((....)))))).)))))).))))..)))))...)))))((((((....((.......))......))))))............(((((......))))).)))))))))))(((........)))))).))....))))))))..((((........)))).........))..))))))))))).(((((.(((((((..((.((((..((((((.(((((((......(((((((((((((....(((((....)))))))))))..))))))).....)))))..))))))))....)))).))..)))((......)).......)))).))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((((..((...})..)))))).(((((((((((..((.((((((((,.((.(((...(((((((((.((((((...((((((((((((({{{{(,(((((,{((((((.{......}.}))))}||}||{{,||},,....||||||..{||||,.,,}}}}|.({{....|||,..,((((((.(((((((,{(((..((((.((.(((((((((((((((...(((((((((.,,,((((,,,,,,..{{{,,,{(({{,.,((((({(({{(((((((((({.{{(((((.,..(((((...(......)...)))))..,.})))}.,,.{{(((.....))))),..,}))))))))),,|.{{{|}|{{{|.(({((((((((.......((((((.{,.,,.....)}...))))))...........|,{,....{((((.,..(((((((....(.((((.....)))).,..)))))))...}}}}},,.)))))))|{(((({.....)))))}....,,|||,,.....,{{{,((((((.((((....((((((....))).)))....)))).))))))...}}})))(((((((({{((.(((((.((((((((,,.((((..(({({({({((...,,....|||..,}}|.|})}||,||,,,|,,,.|||||||{{{((((((.........)))))).,,,,}}|||,(,.,,((((|((((((((...(((((((((((({.,.((((((((..((.....)).)))))))).((((.(({..{({{..,((((...(((((,....((((......))))...,{((((.....,})))}}.})})}...)))),)))},.)))}}}}.||{{{((((((((((.{(({{((((((.(((..((((((((.((((.......)))).))))))))..)))..))))))|,.....{,,...,,,.,,,..,.,(((({,..,,,{,.......,.{,........)).}}}}}}}}}||,||,.}}}}}}})...,...|{{{,...|{(((((..(((((((((........{{{{..{.....}..))}})))))))))...}))))))||||||},,{{{{{{{{|{|||,|,..,.},}}}}}}},},,||||,...,}}},},.(((((((.(((..{,..,,{,.{((((,,,(((,,..{{(,,{{((((({..{{{{,,||||...{,{..(((((((...)))))))..,))),....,||||{..|||,|{{{||{,.....))}))}}},)))))}}|.,,,...,,{,{{{,.{((,{({{,..,,,|{}}|,...)}}),,))}..,}})),)})))..,,,,.,..))),}}}},)))))))))).})))))))))))))..))))))))..}}}}}}.}}.((((((((((...............(((((((((((...)))...((((((...(((((((.((((..........(((((.((....(((({((((....))),}}.))))..)).))))).....(((((.{(.(((...((.(((((.((....)).))))).))..))).)}.)))))......))))))))))).)))))).......(((((((..((.....))..)))).)))......((((((((,....{(((.((.((((((((.((((((((((((,((((.{(((..{,{{(((..(((.,,{{{{{{.,.......)}}}}}..}}},,||(||{,.(((((((....(((........)))...)))))))))))..,,|||}||||{.,{{{...}},},,,((((((({{,{{.........}}.}}.)))),}))}.}}}}})}}.))},{(((({...(((........)))))))))}))))))))......{((.(((((((((.....))))))))).))}))))))))..)).)))))))))))),(((((((,(,...,},},.}))))))..))))))))....)))))))))),|,...{{{(((............((((.......))))}}}}}}.{{((..(((((.{((((.(((((((((.....,...(((((((((((((,(({..{{..((((((....((((((((((((.....)))).}..}))))))..((.((((((...............)))))).}),,.....(({((..(((((((((.{..{{(,.....,..}}}.}.)))))))))..))}..,},))))))..}},,,,{((((((((.(((.((..(((........)))..)))))))))))))|(((((((((...(((...(((.(((((.........,.{((((...)))))}}.,..((((((.....))))))(((.((((((((((.......)).))).)))))))).....(((({....)))))....)))))..)))...))).)))))))))|((((.{.(((((((.,,,(,,,,.....,))))..)))))))..,.)))),...............,,,.))))))))))))).......{{(({,..(((((....))))),,,)})}.))))))))).))))}{{,.....,,(((..(((((,.....,.)))))..))),{{......,}}(((({...}))))...((((...(((.((((((.,(..{......)..,,))))))..)))...))))...))))).)))}||,,,....}}))}))))))))..))))).))..((((((((.((........))...))))))))((((((.{{(({...{((((({(,,.((((.{{..........}}))))..,})}.})))))))||(((((............)))))},..}))))).{(,,..)}{{,,......||}))))}.)))}...(((.(((((.....)))))..)))...........,|,..,.|}|||||,..,,................|||,,,,,)))||||,.,||||||}.,}}}})}}},|})))||{,|||||..{{,,,..(((((((((((((...,.(((((.......({{(({((((.((((......(((((........)))))..)))).)))).))))}))))).,.))))))...))))))).,|{{{,|{|||||,.|.))}},...}}}})))},..........)))))}))|||}}},,}))},,))))).))))..))))))))))..(((((((..((((((,((({..,(((((((,.(({||((,.,,,...,(((({.......}))))|{{||...}}))}|,,}}}.}))))))}))}....{||||,,,...{|{({.,,.)}}}))))))......((((((((..(((.....)))..)))))))).,,...,}})).)).))))..))))))).(((((((((......))))))))))))))))))))..)))))))}..))))))))|{{{{{.....})))).))))))))...)))))...((((((.(((.........))).)))))).((({.(((({{((((,,,......{{,||,((((((...,((((((((.(((...{{(((({{({.,,,,,({(((,{{..(((((((.(((({((((((,{(((((,.,..,,,...)))))}.(((((((.(((((((((........))))))))).)))))))...{((((.,,,(((((((,{{{...}|}|....,|,.{(,{((((((..........)))))))),......((((((...(((,{,....,}.))))))))))))))))}}}))))))))))}........,)).))))))){||}|}}}..||{|,,,,....,},,...},,,.,..,...{|.|(((((((((.........,{,.{{(((({(,({,,,||,}}}}}}}}}}},|((((((((.,,,,.,,}||||}||..,{,.(((,{{{||||{,,,..(((((.((..(((((...,(((,....}}.,),,,)))))..)).)))))(((((........)))))..........{{{|{,...))})}(((((((...)))))))}..,,,,))}),,,))),}}}}}))}))))).})..||,|,}||,||||{.(((....}}}.}))))},)))),.}},..},,.}))))).))))))))...)))))).}}},,,......)))))),..,.,,,)))})))),..)))))).))))))))))(((((((((((.....,.,,((((,(((((((.....)))))))}}}),}|||||,.,,{({,{(({{......}}}},.,,|((((.((((((((((((({(({(,{((({(((,...(((.(((((((........((((((((.,,..(((.....)))....((((....(((((((....))))))).....)))),},...))))))))..)))))))))))))))},|...{(((((..,,,..,,..|,,....}}}))).,.,........((((..,...((((.....)))}.....))))...)).,))......)))))))}}})))).)))),((((({{{{{.{{{,.{{{{((,,,{,.,,,{,,,..............,((,{((((((((((((....(((,,,,.{{{{((,((({(((,{{,({,,,,...((((((((((((...(((((.........{(((((((((.((((((((((((......(((.(((((.(,{((((......))))))))))).)))(((((((....,,)))))},.....((((((.........(((((((.,(((((((.,((.......(({..(((((((....)))))))..)},.)},.},)))))))......)))))))....,,((((({{.....))))))},({.(({{{(({{(((((((....,,......,}....)))))))))))))).)}......(((({,(((((.....))))))))))...))))))...)))))))}..,))))..)))))).................{(((........)))}..)))))))))...)))))))))))).(((((...)))))..........,,((,...|||{{{{{{.....,))}},,}}}}...,|||||.,,,})))))}||{{{{.,{,,......)},))))}|.,|||,,}},}}}}}}).,)))))})})))))))))))))))|((((((....)))))),)))))),)))},,)))))...)))))((((((....,{.......}}......))))))..,,,,},}}}.{((((......))))}.))))))))))){{{........}}}))).)).,..}))))))}..|,{{..,,....|||,...,,,..,))..))))))))))).(((((.{{(((((((({,,,,,..((((((.(((((((......(((((((((((((....,,,,,....}}))}))))))..)))))))..,..)))))..}}))))))....}}}),,}|}},.{{....,,))}}}},..}))),))))).....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GACUCUGUGAGACUGGGAGGAUCAUAGCUGGGGGAGGCUGAGCGUGGGA… 5761 nt 0.4381
AACAGAAGGCAGUUCACCUCUGCUCCCGACAGCCUGGGAACCCGCAAGA… 5741 nt 0.4342
Summary

Predicted to enable G protein-coupled receptor activity. Predicted to be involved in several processes, including adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; energy reserve metabolic process; and fat cell differentiation. Predicted to act upstream of or within several processes, including glomerular filtration; negative regulation of macrophage activation; and pharyngeal arch artery morphogenesis. Located in cell surface and cytoplasmic vesicle. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.