Basic Information

Symbol
CRIP2
RNA class
mRNA
Alias
Cysteine Rich Protein 2 CRP2 ESP1 Cysteine-Rich Protein 2 Cysteine-Rich Intestinal Protein LIM Domain Protein ESP1/CRP2 Protein ESP1 CRP-2 CRIP
Location (GRCh38)
14:105472962-105480162
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001312.4
Sequence length
1178.0 nt
GC content
0.6647

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-515.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -532.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 393.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001270837.2 NCBI
AUCCACUCUUCUGGCAGGGCUGGGGACCUUGGGGCAGGUGGUCUCCCUC… 1661 nt 0.6538
NM_001270841.2 NCBI
GGAGAACGGGCGGAGGGCGCGGGCCGACCGGGCGCACCGACCAUGGCCU… 815 nt 0.6564
NM_001312.4 NCBI
GGAGAACGGGCGGAGGGCGCGGGCCGACCGGGCGCACCGACCAUGGCCU… 1178 nt 0.6647
Summary

This gene encodes a putative transcription factor with two LIM zinc-binding domains. The encoded protein may participate in the differentiation of smooth muscle tissue. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2012]

Forensic Context

A study in humans identified the CRIP2 as a high-degree node in a protein-protein interaction network and a potential myocardial infarction biomarker, showing downregulation in patient blood samples though electronic validation indicated upregulation [Zhao et al. DOI:10.3892/etm.2017.5580]. Another human study found the CRIP2 is part of a 38-gene transcriptomic signature of obesity, with its expression coefficient positively correlating with body mass index and fat mass in subcutaneous adipose tissue [Font-Clos et al. DOI:10.1088/1361-6579/aab85a].