Basic Information

Symbol
CRISP1
RNA class
mRNA
Alias
Cysteine Rich Secretory Protein 1 CRISP-1 ARP HSCRISP1D HSCRISP1G HUMARP AEGL1 Acidic Epididymal Glycoprotein Homolog Acidic Epididymal Glycoprotein-Like 1 Cysteine-Rich Secretory Protein 1 AEG-Like Protein Cysteine-Rich Secretory Protein-1 Delta Epididymis Secretory Protein Li 57 AEG-Related Protein HEL-S-57
Location (GRCh38)
6:49834257-49877096
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001131.3
Sequence length
1918.0 nt
GC content
0.3738

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-414.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -456.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 650.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001131.3 NCBI
AUUGAACAAAUCUCCCCUGUGGACUGUCAUUUAAAAGCACAAAUACACU… 1918 nt 0.3738
NM_001205220.2 NCBI
AGUUUCUUUGCAGCUACCAGGACAGAGCUUGGUGAGAUAAUUCUUUUAU… 1899 nt 0.3718
NM_170609.2 NCBI
AUUGAACAAAUCUCCCCUGUGGACUGUCAUUUAAAAGCACAAAUACACU… 1829 nt 0.3707
Summary

Fertilization consists of a sequence of specific cell-cell interactions culminating in the fusion of the sperm and egg plasma membranes. Recognition, binding, and fusion occur through the interaction of complementary molecules that are localized to specific domains of the sperm and egg plasma membranes. In the sperm, the postacrosomal region or equatorial segment is involved in sperm-egg plasma membrane fusion. The protein encoded by this gene is a member of the cysteine-rich secretory protein (CRISP) family. It is expressed in the epididymis, is secreted into the epididymal lumen, and binds to the postacrosomal region of the sperm head, where it plays a role in sperm-egg fusion. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CRISP1 exhibited a Gini impurity score of 0, being present in all pure seminal fluid samples and in mixtures containing semen while being absent in mixtures without semen, confirming its role as a highly discriminatory protein for seminal fluid classification in forensic proteomic workflows [Shehata et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2025.103343].