Basic Information

Symbol
CRISPLD2
RNA class
mRNA
Alias
Cysteine Rich Secretory Protein LCCL Domain Containing 2 LCRISP2 LGL1 Cysteine-Rich Secretory Protein LCCL Domain-Containing 2 LCCL Domain-Containing Cysteine-Rich Secretory Protein 2 Cysteine-Rich Secretory Protein 11 Late Gestation Lung 1 DKFZP434B044 CRISP-11 CRISP11 LCCL Domain Containing Cysteine-Rich Secretory Protein 2 Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 207a Trypsin Inhibitor
Location (GRCh38)
16:84819981-84920768
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_031476.4
Sequence length
4583.0 nt
GC content
0.5099

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1558.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1643.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1072.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_031476.4 NCBI
ACUCGCAUCCCAGGGCGUCUCCGGCUGCUCCUAUUGAGCUGUCUGCUCG… 4583 nt 0.5099
Summary

Predicted to enable glycosaminoglycan binding activity. Involved in face morphogenesis. Located in transport vesicle. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the CRISPLD2 as an mRNA marker with diurnally rhythmic expression, showing peak expression at 14:00h and a valley at 02:00h [Gosch et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102915]. A subsequent targeted RNA sequencing study in humans confirmed the CRISPLD2 as a candidate predictor, where it contributed a coefficient in the final penalised regression model's sine component for time-of-day prediction [Gosch et al. DOI:10.1101/2025.02.03.636230].