Basic Information

Symbol
CRLF2
RNA class
mRNA
Alias
Cytokine Receptor Like Factor 2 TSLPR CRL2 Thymic Stromal Lymphopoietin Protein Receptor Cytokine Receptor-Like Factor 2 TSLP Receptor IL-XR Thymic Stromal-Derived Lymphopoietin Receptor Cytokine Receptor CRL2 Precusor Cytokine Receptor-Like 2 CRLF2Y ILXR
Location (GRCh38)
X:1190490-1212723
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022148.4
Sequence length
1538.0 nt
GC content
0.5351

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-525.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -554.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 486.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001012288.3 NCBI
ACUCCUGUUUCAGGCAUGGGGCGGCUGGUUCUGCUGUGGGGAGCUGCCG… 1435 nt 0.5415
NM_022148.4 NCBI
ACUCCUGUUUCAGGCAUGGGGCGGCUGGUUCUGCUGUGGGGAGCUGCCG… 1538 nt 0.5351
Summary

This gene encodes a member of the type I cytokine receptor family. The encoded protein is a receptor for thymic stromal lymphopoietin (TSLP). Together with the interleukin 7 receptor (IL7R), the encoded protein and TSLP activate STAT3, STAT5, and JAK2 pathways, which control processes such as cell proliferation and development of the hematopoietic system. Rearrangement of this gene with immunoglobulin heavy chain gene (IGH) on chromosome 14, or with P2Y purinoceptor 8 gene (P2RY8) on the same X or Y chromosomes is associated with B-progenitor acute lymphoblastic leukemia (ALL) and Down syndrome ALL. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2014] CIViC Summary for CRLF2 Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.