Basic Information

Symbol
CSF3R
RNA class
mRNA
Alias
Colony Stimulating Factor 3 Receptor G-CSF-R GCSFR Granulocyte Colony-Stimulating Factor Receptor Colony Stimulating Factor 3 Receptor (Granulocyte) G-CSF Receptor CD114 Antigen CD114 SCN7
Location (GRCh38)
1:36465669-36483322
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden death from CNS diseases Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000760.4
Sequence length
3008.0 nt
GC content
0.6031

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1239.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1287.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 622.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000760.4 NCBI
AGAGCUCGGGGAGAGAAGCUGGACUGCAGCUGGUUUCAGGAACUUCUCU… 3008 nt 0.6031
NM_156039.3 NCBI
GAGUACUGUGAAGAUGUGGUCCCCAAGGCUAGAGCUGAAAAGAGGCUUA… 3500 nt 0.6063
NM_172313.3 NCBI
AGAGCUCGGGGAGAGAAGCUGGACUGCAGCUGGUUUCAGGAACUUCUCU… 2588 nt 0.6001
Summary

The protein encoded by this gene is the receptor for colony stimulating factor 3, a cytokine that controls the production, differentiation, and function of granulocytes. The encoded protein, which is a member of the family of cytokine receptors, may also function in some cell surface adhesion or recognition processes. Alternatively spliced transcript variants have been described. Mutations in this gene are a cause of Kostmann syndrome, also known as severe congenital neutropenia. [provided by RefSeq, Aug 2010] CIViC Summary for CSF3R Gene

Forensic Context

A study in human traumatic brain injury (TBI) patients identified the CSF3R as a top five upregulated long noncoding RNA in brain contusion tissues, with its expression validated by qRT-PCR [Zhang et al. DOI:10.097/WNR.0000000000001756]. In a separate human study on acute myocardial infarction (AMI), the CSF3R was identified as an immune-related hub gene significantly upregulated in AMI patient blood compared to coronary heart disease controls, with its expression decreasing from day 1 to one month post-AMI and demonstrating an AUC of 0.845 for discriminating AMI [Liu et al. DOI:10.1042/BSR20222552]. In a rat model of acute right heart failure, the CSF3R gene was enriched in the cytokine-cytokine receptor interaction pathway within the right ventricle, indicating its involvement in molecular pathways associated with cardiac stress [Cao et al. DOI:10.1177/2045894019879396].