Basic Information

Symbol
CSMD1
RNA class
mRNA
Alias
CUB And Sushi Multiple Domains 1 KIAA1890 PPP1R24 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 24 CUB And Sushi Domain-Containing Protein 1 CUB And Sushi Multiple Domains Protein 1
Location (GRCh38)
8:2935353-4994972
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden unexpected death diagnosis Forensic psychiatry evaluation Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033225.6
Sequence length
14417.0 nt
GC content
0.4885

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4669.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4929.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3763.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_033225.6 NCBI
CUCCACGGCAGCGGCUCCUUGUGCCACUAGCAGCCCUUCUUCUGCGCUC… 14417 nt 0.4885
Summary

Predicted to act upstream of or within several processes, including learning or memory; mammary gland branching involved in pregnancy; and reproductive structure development. Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified CSMD1 as a significantly upregulated RNA biomarker in cardiomyocytes of sudden unexplained death in schizophrenia (SUD-SCZ) cases, associating it with disease pathogenesis [Chen et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2025.112646]. Separately, in cultured human endothelial cells, CSMD1 mRNA was identified as a radiation-responsive biomarker, useful for differentiating unirradiated (0 Gy) from irradiated samples and for dose classification at 72 hours post-exposure, with its expression validated by qRT-PCR [Chopra et al. DOI:10.1038/s41598-022-24051-6].