Basic Information

Symbol
CTC1
RNA class
mRNA
Alias
CST Telomere Replication Complex Component 1 C17orf68 AAF132 CST Telomere Maintenance Complex Component 1 Conserved Telomere Maintenance Component 1 Conserved Telomere Capping Protein 1 HBV DNAPTP1-Transactivated Protein B Alpha Accessory Factor 132 CST Complex Subunit CTC1 FLJ22170 CTS Telomere Maintenance Complex Component 1 Chromosome 17 Open Reading Frame 68 Tmp494178 AAF-132 CRMCC
Location (GRCh38)
17:8224815-8248058
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_025099.6
Sequence length
7039.0 nt
GC content
0.5343

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2551.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2678.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2315.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001411067.1 NCBI
GGGCGGAGCUCCGGCGCAUCAUGGCGGCUGGCCGGGCCCAGGUCCCUUC… 6808 nt 0.5323
NM_025099.6 NCBI
GGGCGGAGCUCCGGCGCAUCAUGGCGGCUGGCCGGGCCCAGGUCCCUUC… 7039 nt 0.5343
Summary

This gene encodes a component of the CST complex. This complex plays an essential role in protecting telomeres from degradation. This protein also forms a heterodimer with the CST complex subunit STN1 to form the enzyme alpha accessory factor. This enzyme regulates DNA replication. Mutations in this gene are the cause of cerebroretinal microangiopathy with calcifications and cysts. Alternate splicing results in both coding and non-coding variants. [provided by RefSeq, Mar 2012]

Forensic Context

A review of forensic proteomics literature notes that the CTC1 is a protein marker showing loss post-mortem in bone, indicating its potential for post-mortem interval estimation in late PMI contexts within human and animal model studies [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].