Basic Information
Symbol
ADIPOR1
RNA class
mRNA
Alias
Adiponectin Receptor 1
PAQR1
ACDCR1
Progestin And AdipoQ Receptor Family Member 1
Progestin And AdipoQ Receptor Family Member I
Adiponectin Receptor Protein 1
TESBP1A
CGI-45
CGI45
Location (GRCh38)
1:202940090-202958572
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_015999.6
Sequence length
2091.0 nt
GC content
0.5041
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-706.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-743.05 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
536.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACUGCGCGCCGCCUCCGAGGCGGCCUAGGUGCGGUGGGCGCUCGUCCCC… | 2039 nt | 0.4949 | |
| AUUGGGACUCCGCGAGAGGGCCUAGGAUUGGAGGGCCCAGGCAGAGCCC… | 2251 nt | 0.5078 | |
| AUCACGCACUUCAGGCUGCGAUAACGAGGUGGAGUGUAGAAUCCGACGA… | 2137 nt | 0.4871 | |
| AGGUCGCGCGCCCCUUCCGGCGCGGGGAGGGCGCUGAAGAUCGGGGCCG… | 2091 nt | 0.5041 |
Summary
This gene encodes a protein which acts as a receptor for adiponectin, a hormone secreted by adipocytes which regulates fatty acid catabolism and glucose levels. Binding of adiponectin to the encoded protein results in activation of an AMP-activated kinase signaling pathway which affects levels of fatty acid oxidation and insulin sensitivity. A pseudogene of this gene is located on chromosome 14. Multiple alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2014]
Forensic Context
A study in human post-mortem blood samples demonstrated that the ADIPOR1 shows an up-regulated expression pattern after death and is involved in the positive regulation of insulin receptor signaling pathway, with its expression data used for post-mortem interval (PMI) estimation [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z]. A separate scoping review of human twin studies reported that muscle mRNA expression of the ADIPOR1 was correlated with birth weight in elderly twins [Dany Laure Wadji et al. DOI:10.1371/journal.pone.0315549].