Basic Information

Symbol
CTSO
RNA class
mRNA
Alias
Cathepsin O CTSO1 EC 3.4.22.42
Location (GRCh38)
4:155921580-155953912
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001334.3
Sequence length
2903.0 nt
GC content
0.3972

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-753.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -814.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 798.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001334.3 NCBI
AGAGGAGCCGGGCGCCGCAAUGGACGUGCGGGCGCUGCCGUGGCUGCCG… 2903 nt 0.3972
Summary

The protein encoded by the gene is a cysteine proteinase and a member of the papain superfamily. This proteolytic enzyme is involved in cellular protein degradation and turnover. The recombinant form of this enzyme was shown to degrade synthetic peptides typically used as substrates for cysteine proteinases and its proteolytic activity was abolished by an inhibitor of cyteine proteinase. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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