Basic Information

Symbol
CTSV
RNA class
mRNA
Alias
Cathepsin V CTSU Cathepsin L2 CTSL2 Cathepsin U CATL2 Cathepsin L2, Preproprotein EC 3.4.22.43 EC 3.4.22
Location (GRCh38)
9:97025073-97156556
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001333.4
Sequence length
4359.0 nt
GC content
0.4155

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1253.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1339.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1195.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001201575.2 NCBI
CUUCUAAAGCCCUGAUGCACCCACCCUUAAGUGGAAGGUUUUGAAACAU… 4324 nt 0.4128
NM_001333.4 NCBI
ACCAGACCGCGGACGUCUGUAAUCUCAGAGGCUUGUUUGCUGAGGGUGC… 4359 nt 0.4155
Summary

The protein encoded by this gene, a member of the peptidase C1 family, is a lysosomal cysteine proteinase that may play an important role in corneal physiology. This gene is expressed in colorectal and breast carcinomas but not in normal colon, mammary gland, or peritumoral tissues, suggesting a possible role for this gene in tumor processes. Alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Jan 2011]

Forensic Context

A review of human multi-omics studies for biological age estimation identified the CTSV as a top protein associated with aging in plasma SOMAscan analysis [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192].