Basic Information

Symbol
CTTNBP2NL
RNA class
mRNA
Alias
CTTNBP2 N-Terminal Like CTTNBP2 N-Terminal-Like Protein DKFZp547A023 KIAA1433
Location (GRCh38)
1:112396202-112463456
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018704.3
Sequence length
5864.0 nt
GC content
0.4180

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1584.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1699.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1776.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018704.3 NCBI
AGCCGCUGUGGAUGGGGAGUGGAGGCGGAGGGGAGCGGAGCCCGGAGCG… 5864 nt 0.4180
Summary

Enables protein phosphatase 2A binding activity. Acts upstream of or within negative regulation of transmembrane transport; negative regulation of transporter activity; and protein dephosphorylation. Located in actin cytoskeleton. Part of FAR/SIN/STRIPAK complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic alcohol exposure significantly upregulated the CTTNBP2NL mRNA in hippocampal tissue, as identified through high-throughput sequencing and bioinformatic network analysis [Du et al. DOI:10.3389/Fphar.2024.1377501].