Basic Information

Symbol
CUL4A
RNA class
mRNA
Alias
Cullin 4A Cullin-4A CUL-4A
Location (GRCh38)
13:113208193-113267108
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001008895.4
Sequence length
5821.0 nt
GC content
0.4290

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1774.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1887.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1434.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001008895.4 NCBI
GGUUCCGGCCCAGCCAUGGCGGACGAGGCCCCGCGGAAGGGCAGCUUCU… 5821 nt 0.4290
NM_001278513.3 NCBI
AUUCAUCCCGCAUCCUGCUGGGAAACAGCGUCCAUCCGACACAGCACCG… 6073 nt 0.4406
NM_001278514.3 NCBI
ACUUCCGGCCCUCGGUCCGUCUGGGUCCUGGCGCCCCCGGCCCCGCCGC… 5741 nt 0.4236
NM_001354938.2 NCBI
ACUUCCGGCCCUCGGUCCGUCUGGGUCCUGGCGCCCCCGGCCCCGCCGC… 5717 nt 0.4238
NM_001354939.2 NCBI
CCUGGGGACCGGCUCGGCGACGCGCUCGGGCUGAGGGGGCCCGGGGUCU… 5730 nt 0.4250
NM_001354940.2 NCBI
GGUUCCGGCCCAGCCAUGGCGGACGAGGCCCCGCGGAAGGGCAGCUUCU… 5796 nt 0.4284
NM_001354941.2 NCBI
GGUUCCGGCCCAGCCAUGGCGGACGAGGCCCCGCGGAAGGGCAGCUUCU… 5819 nt 0.4289
NM_001354942.2 NCBI
GGUUCCGGCCCAGCCAUGGCGGACGAGGCCCCGCGGAAGGGCAGCUUCU… 5817 nt 0.4289
NM_001354943.2 NCBI
GGUUCCGGCCCAGCCAUGGCGGACGAGGCCCCGCGGAAGGGCAGCUUCU… 1105 nt 0.5792
NM_001354944.2 NCBI
CCUGGGGACCGGCUCGGCGACGCGCUCGGGCUGAGGGGGCCCGGGGUCU… 1039 nt 0.5698
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

CUL4A is the ubiquitin ligase component of a multimeric complex involved in the degradation of DNA damage-response proteins (Liu et al., 2009 [PubMed 19481525]).[supplied by OMIM, Oct 2009]

Forensic Context

A review of multi-omics studies in humans identified the CUL4A as part of the ubiquitin-associated proteolytic pathway and found it to be associated with aging in the Framingham Offspring cohort [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192].