Basic Information

Symbol
CUL4B
RNA class
mRNA
Alias
Cullin 4B Cullin-4B CUL-4B KIAA0695 MRXHF2 MRXS15 MRXSC SFM2
Location (GRCh38)
X:120505920-120604074
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001079872.2
Sequence length
5915.0 nt
GC content
0.3807

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1522.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1636.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1667.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001079872.2 NCBI
AGACUCGCUGAGUCGCUCCUGCAGAAAGGGGGGGAGAGAGAUCGAAAAG… 5915 nt 0.3807
NM_001330624.2 NCBI
CUUCCCCCCCCCACUCAAGUCCUGCGGACCUGGGGGCUUCGGGAUCUGG… 5660 nt 0.3735
NM_001369145.1 NCBI
GUGCUGAAGCAUACACCGGGUGUUUCUGUGCAGUAUUUUGAGGUCUUUU… 4401 nt 0.3606
NM_003588.4 NCBI
GGGCAGAACCUAGCCCGCCGAAAGGGCGGGCAUUGCUAAAGUGUUUUCA… 5785 nt 0.3746
Summary

This gene is a member of the cullin family. The encoded protein forms a complex that functions as an E3 ubiquitin ligase and catalyzes the polyubiquitination of specific protein substrates in the cell. The protein interacts with a ring finger protein, and is required for the proteolysis of several regulators of DNA replication including chromatin licensing and DNA replication factor 1 and cyclin E. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the CUL4B in microglia, where it is involved in the ubiquitin-mediated proteolysis pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].