Basic Information

Symbol
CUL5
RNA class
mRNA
Alias
Cullin 5 VACM-1 Vasopressin-Activated Calcium-Mobilizing Receptor 1 Cullin-5 CUL-5 VACM1 Cullin-5 (Vasopressin-Activated Calcium-Mobilizing Receptor-1) Vasopressin-Activated Calcium-Mobilizing Receptor-1
Location (GRCh38)
11:108008898-108107781
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003478.6
Sequence length
6171.0 nt
GC content
0.3581

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1566.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1691.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1381.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003478.6 NCBI
GCGCGUCCCCGCCCUCGCGUCACGUGACGUGGCCGCGGAACCUGAGCUG… 6171 nt 0.3581
Summary

Enables ubiquitin ligase complex scaffold activity and ubiquitin protein ligase binding activity. Involved in proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process and protein K11-linked ubiquitination. Located in site of DNA damage. Part of Cul5-RING ubiquitin ligase complex. Is active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A meta-analysis of human mTBI patients identified a network of 33 validated interacting proteins and their regulatory miRNAs linking post-mTBI signaling in peripheral fluids with neurodegeneration-associated pathways [Matyasova et al. DOI:10.4149/gpb_2021038].