Basic Information

Symbol
ABCA6
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily A Member 6 EST155051 ATP-Binding Cassette, Sub-Family A (ABC1), Member 6 ATP-Binding Cassette Sub-Family A Member 6 ATP-Binding Cassette A6 ABC Transporter ABCA6 EC 2.5.1.19 EC 3.6.3.25 EC 7.6.2.- EC 3.6.3
Location (GRCh38)
17:69074255-69142031
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_080284.3
Sequence length
5321.0 nt
GC content
0.3845

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1366.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1475.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1499.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_080284.3 NCBI
AGAAACCAGGCUGUGUAAGAGCUGCUGGAGUAGGCACCCAUUUAAAGAA… 5321 nt 0.3845
Summary

The membrane-associated protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intracellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, and White). This encoded protein is a member of the ABC1 subfamily. Members of the ABC1 subfamily comprise the only major ABC subfamily found exclusively in multicellular eukaryotes. This gene is clustered among 4 other ABC1 family members on 17q24 and may play a role in macrophage lipid homeostasis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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