Basic Information

Symbol
CYC1
RNA class
mRNA
Alias
Cytochrome C1 UQCR4 Ubiquinol-Cytochrome-C Reductase Complex Cytochrome C1 Subunit Cytochrome C1, Heme Protein, Mitochondrial Cytochrome B-C1 Complex Subunit 4 Complex III Subunit IV Complex III Subunit 4 Cytochrome C-1 EC 7.1.1.8 MC3DN6
Location (GRCh38)
8:144095039-144097525
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001916.5
Sequence length
1191.0 nt
GC content
0.6154

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-522.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -541.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 256.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001916.5 NCBI
GGCGGCCGCGCGGAGGAGGCCAAGAUGGCGGCAGCUGCGGCUUCGCUUC… 1191 nt 0.6154
Summary

This gene encodes a subunit of the cytochrome bc1 complex, which plays an important role in the mitochondrial respiratory chain by transferring electrons from the Rieske iron-sulfur protein to cytochrome c. Mutations in this gene may cause mitochondrial complex III deficiency, nuclear type 6. [provided by RefSeq, Dec 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CYC1 gene, encoding cytochrome C-1, was downregulated in brain tissue at 8 and 24 hours after whole-body ionizing radiation exposure, with fold changes of 0.454 and 0.422 respectively, indicating a significant metabolic response to radiation injury [Zhao et al. DOI:10.1158/1078-0432.CCR-05-2418]. In human post-mortem tissues, the CYC1 gene was downregulated as part of the inhibited respiratory electron transport pathway in the prefrontal cortex, hippocampus, kidneys, and heart of sepsis patients, highlighting its role in metabolic dysfunction during septic shock [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].