Basic Information

Symbol
CYCS
RNA class
mRNA
Alias
Cytochrome C, Somatic CYC HCS Cytochrome C THC4
Location (GRCh38)
7:25118656-25125266
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018947.6
Sequence length
5432.0 nt
GC content
0.4122

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2013.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2110.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1208.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018947.6 NCBI
AGAGAGUGGGGACGUCCGGCUUCGGAGCGGGAGUGUUCGUUGUGCCAGC… 5432 nt 0.4122
Summary

This gene encodes a small heme protein that functions as a central component of the electron transport chain in mitochondria. The encoded protein associates with the inner membrane of the mitochondrion where it accepts electrons from cytochrome b and transfers them to the cytochrome oxidase complex. This protein is also involved in initiation of apoptosis. Mutations in this gene are associated with autosomal dominant nonsyndromic thrombocytopenia. Numerous processed pseudogenes of this gene are found throughout the human genome.[provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the protein expression of the CYCS was not directly applied to postmortem interval estimation in the experimental design [Xie et al. DOI:10.1007/S12024-023-00757-5].