Basic Information

Symbol
CYFIP1
RNA class
mRNA
Alias
Cytoplasmic FMR1 Interacting Protein 1 P140SRA-1 KIAA0068 SHYC Cytoplasmic FMRP Interacting Protein 1 Cytoplasmic FMR1-Interacting Protein 1 Specifically Rac1-Associated Protein 1 Selective Hybridizing Clone P140sra-1 SRA-1 Sra-1 SRA1
Location (GRCh38)
15:22867052-22981063
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014608.6
Sequence length
6826.0 nt
GC content
0.4770

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2205.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2329.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1622.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001033028.3 NCBI
CCGGUUUAAUCCACACCGCUGCGUCUGUCCUCCGUCCUGGGGCUGGUCU… 5747 nt 0.4656
NM_001287810.4 NCBI
AUUCCCGGCCAGCCCGAGUGACUCACUCGGCCAAGGAAACUCCCAGGGC… 6945 nt 0.4792
NM_001324119.2 NCBI
GCAGGCAAUGGGGCCGCAGGGGCCGGCCGGGGGGGUCCCCAGCGGGCUC… 6860 nt 0.4780
NM_001324120.2 NCBI
UGCGCGCCGACCUGCAGCUGGGACCCGCGCCUGGAACCCUCCCGACGAG… 7039 nt 0.4847
NM_001324122.3 NCBI
AUUCCCGGCCAGCCCGAGUGACUCACUCGGCCAAGGAAACUCCCAGGGC… 6974 nt 0.4792
NM_001324123.3 NCBI
AUUCCCGGCCAGCCCGAGUGACUCACUCGGCCAAGGAAACUCCCAGGGC… 6853 nt 0.4770
NM_001324124.3 NCBI
AUUCCCGGCCAGCCCGAGUGACUCACUCGGCCAAGGAAACUCCCAGGGC… 6736 nt 0.4779
NM_001324125.3 NCBI
AUUCCCGGCCAGCCCGAGUGACUCACUCGGCCAAGGAAACUCCCAGGGC… 6535 nt 0.4724
NM_001324126.3 NCBI
AUUCCCGGCCAGCCCGAGUGACUCACUCGGCCAAGGAAACUCCCAGGGC… 6724 nt 0.4774
NM_014608.6 NCBI
AUUCCCGGCCAGCCCGAGUGACUCACUCGGCCAAGGAAACUCCCAGGGC… 6826 nt 0.4770
Summary

This gene encodes a protein that regulates cytoskeletal dynamics and protein translation. The encoded protein is a component of the WAVE regulatory complex (WRC), which promotes actin polymerization. This protein also interacts with the synaptic functional regulator FMR1 protein and translation initiation factor 4E to inhibit protein translation. A large chromosomal deletion including this gene is associated with increased risk of schizophrenia and epilepsy in human patients. Reduced expression of this gene has been observed in various human cancers and the encoded protein may inhibit tumor invasion. [provided by RefSeq, Mar 2022]

Forensic Context

A study in rats (Rattus norvegicus) demonstrated that the CYFIP1 was significantly altered in expression on day 4 following a 20% total body surface area burn injury, as part of a comprehensive analysis of 740 significantly altered hepatic genes [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].