Basic Information

Symbol
CYFIP2
RNA class
mRNA
Alias
Cytoplasmic FMR1 Interacting Protein 2 PIR121 Cytoplasmic FMR1-Interacting Protein 2 P53-Inducible Protein 121 P53 Inducible Protein KIAA1168 EIEE65 DEE65
Location (GRCh38)
5:157266079-157395595
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001037333.3
Sequence length
6452.0 nt
GC content
0.4978

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2094.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2210.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1790.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001037333.3 NCBI
AGAGCAUCCUGCGCCCCGGCGCGGGGCCCUGCGGUAGCCUCAGGCCCCU… 6452 nt 0.4978
NM_001291721.2 NCBI
AGAGCAUCCUGCGCCCCGGCGCGGGGCCCUGCGGUAGCCUCAGGCCCCU… 6374 nt 0.4969
NM_001291722.2 NCBI
AGAGCAUCCUGCGCCCCGGCGCGGGGCCCUGCGGUAGCCUCAGGCCCCU… 6527 nt 0.4998
NM_014376.4 NCBI
AUUCUCACAUUUCAACACGUAGAGUUAAGGAAGGGCCUCUUCCUCUGUG… 6639 nt 0.4947
Summary

Predicted to enable small GTPase binding activity. Involved in several processes, including cell-cell adhesion; positive regulation of proteolysis; and regulation of postsynapse assembly. Located in perinuclear region of cytoplasm and synapse. Part of SCAR complex. Implicated in developmental and epileptic encephalopathy 65. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that traumatic brain injury induces widespread changes in gene expression, with 104 of approximately 1200 expressed genes showing differential regulation in pericontusional tissue [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003].