Basic Information

Symbol
CYP2A7
RNA class
mRNA
Alias
Cytochrome P450 Family 2 Subfamily A Member 7 CYP2A Cytochrome P450, Subfamily IIA (Phenobarbital-Inducible), Polypeptide 7 Cytochrome P450, Family 2, Subfamily A, Polypeptide 7 Cytochrome P450 IIA4 Cytochrome P450 2A7 EC 1.14.14.1 CYPIIA7 Cytochrome P450IIA4 P450-IIA4 CPA7 CPAD
Location (GRCh38)
19:40875432-40882752
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000764.3
Sequence length
1760.0 nt
GC content
0.5631

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-673.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -705.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 628.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((.((((.(((((((((((((((((.((((((((((...))))))))))..))))...(((.(((((((((.(.....).)))))..)))))))..((((.((((((((......((....)).....)))).)))).))))..((((.......))))(((((((.((((((((....))).))).....))..)))))))....(((..(((((((((.........)))..))))))..)))(((((((((((((((((((((........)))......((((((((((.((..(.((((((((((.((.......)))))).((((..((((..((((((........(((.(((((((...(((......)))...)))))))))).((((((..(((((((.....((((((((((....))))))))))....)))))))....))))))..))))))..))))...)))))))))).)..))))).))))))).))))))))))))....)))))).....(((((((...(((((...(((((....((....((((((.(((((((((((((......((((.(((((.....((((((...(((....)))(((((((((((.((((((((((((((.(((((.((.....((((((.(((...))).))))))....))))))).....(((...)))....(((((((..........)))))))...))))))))))).))).)))).(((((((.(((((....(((((....)))))...(((.(((....((((.((((.((..(((((((..(((....)))..)))))))..))(((((.((.....)).)))))..........((((((((.(((..........))).))))..))))..((((((((((..((.((((((((.((((((((........)).)))..)))...))).)))))..))..((((((.(((((.....((..((((..((((((.....(((.((((((.((.((.(((..(.((...(.((((((....(((((.((.(((((.((((((((((....))))....(((.(((.......((((((((...))))))))..))))))...))))))))))).)).)))))...)))))).)...)).)))).)).))))))))))))))))).........))))..))......)))))))))))......((.((.(((((..((((..((((((((....(((..........)))...))))))))..))))))))))))).)))))))))).)))).))))....)))))).)))))...))))))).......))))))).))))))...)))))))))......))).)))))))))).))((((((.......)))))).((((((.((.(((.(((.((...((..(((....(((((((((((((((..((.(((.((((......)))).))).)).))))))).)))))...)))..)))..)).))))).))).)).))))))))))....))....)))))...)))))...))))))))))))))))).))).)))).))..)))..(((...((((((.(..((((((...))))))...).))))))(((((((((.((((....))))......((((((..............)))))).))))))))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((,(({((((.{{,,,{((({(((((((.{(((((((((,,.||||||||||,{}|||{(((((.((({(({{{,(,{,.{|{|||||,|||}||}}|,((((.((((((((......((....))..,..)))).)))).)))}..,{{,,{{{.{{||||((({..({({((((,{...(.{(((,.(({{{{|..|{{{{,,.{{{((({{((((((({(..,.{{{...,..))))),}..|},|||||||||||||,,,||}}}}}}}}}..)))}.)...|||||||||,.{|.}|}|||||}||||}||}}}}.,})).)))}||||,}|{{{,.{{{(((({,,..||{{|.((((((((({{{,.,,...,{|{{||||||,,.||.|||||{,,(({{(((,..,|((((((((({....}))))))))),,..))))))),..,}|))))}|,|||||,,||||..|||}}}}}}}|{|{{|||},.|||},}}.,,},)))}))),...,)))}))).}},|||||||,.}||||,,,,{|{{{,,,||{,..,{{{{|||{|{|{|||||||}.,,.{((((..{((({,,.{{({|{{{((({({.(({...}}}|||}|,|}|||}}}})}},|}}}}.)))),.({{{{{||{{{{.{({...))).}))))}((({(((.{((({...(((.((((..((.(((((((..........)))))))...)).)))))))..))))).))),,))}})))))).....(((((....)))))........||}}},,|||,|(((,((..((((((({{(((....))).})))))))..))(((((,({.....)).)))))...,},}}..|||||||{,{{{...,,,,.,.}}}.)))},}}}))|.((({{{{{{|..{(.((((((((.({{{{{((,,,..,..}}.))}},)))...))).))))).,))..{{((((.(((((,|,{{|,,|||{{..((((((.....(((.((((({,((.{{.(({..(,((...(.((((((....(((((.{{.(((((.((((((((((....)))),..,(((.{{{.,,,...((((((((...))))))))..}}}}})...})))))))))).}}.)))))...)))))).)...}}}}))),)}.))))))))))))))))).......,,||||||}|||}},,}})))))))}|...,{{{{.((.(((((..((((..((((((((....,{{{({{,,...,)))}}.))))))))..))))))))))))),)))))))))),}}}}}))))}}},},})))})||{{{{(({((((({,{{{{{{{{,{{{.,..{(((({({((,..((((((((.{{{{{{..((((({....}))))).,,.....|{{{({((({|((.{(({(((.{{...{,..,,,....{{(((((((((((((.,{(.(((.((((......)))).))).)).)))))))},))))}..})}}))))}.})}))))).)))})}..}})),))))....)).)))))))).},,))))},.,)}}}),}))))))))).,,),))))})))))},...,||,|{({(((.{..((((({...,))))),,,).))))))|||{{{{((.((((....))))..,,,,((((((.....}},}}..,,)),}},.))))))},,,,...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000764.3 NCBI
AUCUGUCAUCUCACUACCACCAUGCUGGCCUCAGGGCUGCUUCUGGUGG… 1760 nt 0.5631
NM_030589.3 NCBI
AUCUGUCAUCUCACUACCACCAUGCUGGCCUCAGGGCUGCUUCUGGUGG… 1607 nt 0.5576
Summary

This gene encodes a member of the cytochrome P450 superfamily of enzymes. The cytochrome P450 proteins are monooxygenases which catalyze many reactions involved in drug metabolism and synthesis of cholesterol, steroids and other lipids. This protein localizes to the endoplasmic reticulum; its substrate has not yet been determined. This gene, which produces two transcript variants, is part of a large cluster of cytochrome P450 genes from the CYP2A, CYP2B and CYP2F subfamilies on chromosome 19q. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CYP2A7 is a vaginal secretion-specific coding region SNP (cSNP) targeted in a massively parallel sequencing assay for body fluid identification and donor attribution [Trnka et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2026.103455]. In an evaluation of mixed biological stains, the CYP2A7 was part of a panel of three cSNPs for vaginal secretion, though this fluid exhibited the lowest estimated read counts and highest variation, leading to frequent allelic dropout and poor discrimination power in mixtures [Dørum et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2022.102685].