Basic Information

Symbol
CYP4A11
RNA class
mRNA
Alias
Cytochrome P450 Family 4 Subfamily A Member 11 CYP4AII CYP4A2 Cytochrome P450, Family 4, Subfamily A, Polypeptide 11 Cytochrome P450, Subfamily IVA, Polypeptide 11 Long-Chain Fatty Acid Omega-Monooxygenase 20-Hydroxyeicosatetraenoic Acid Synthase Lauric Acid Omega-Hydroxylase Fatty Acid Omega-Hydroxylase Cytochrome P-450HK-Omega Cytochrome P450HL-Omega Cytochrome P450 4A11 20-HETE Synthase CYPIVA11 Alkane-1 Monooxygenase EC 1.14.14.80 P450HL-Omega EC 1.14.14.1 CP4Y
Location (GRCh38)
1:46928862-46941594
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000778.4
Sequence length
2530.0 nt
GC content
0.5439

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-856.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -903.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 650.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000778.4 NCBI
AGAGAGAGGUAGGGGCACUCAGAGAUCCAGCAGGUGCUGCACCAUGAGU… 2530 nt 0.5439
NM_001319155.2 NCBI
AGAGAGAGGUAGGGGCACUCAGAGAUCCAGCAGGUGCUGCACCAUGAGU… 2434 nt 0.5472
NM_001363587.2 NCBI
AGAGAGAGGUAGGGGCACUCAGAGAUCCAGCAGGUGCUGCACCAUGAGU… 2236 nt 0.5411
Summary

This gene encodes a member of the cytochrome P450 superfamily of enzymes. The cytochrome P450 proteins are monooxygenases which catalyze many reactions involved in drug metabolism and synthesis of cholesterol, steroids and other lipids. This protein localizes to the endoplasmic reticulum and hydroxylates medium-chain fatty acids such as laurate and myristate. Multiple transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

A study in human cardiac tissue demonstrated that the CYP4A11 (CYP4A11) is a direct target of miR-3185, with its mRNA and protein levels significantly reduced in cases of mechanical asphyxia compared to other causes of death such as craniocerebral injury, hemorrhagic shock, sudden cardiac death, and poisoning [Han et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2020.110293]. Separately, in human circulating leukocytes, the expression of the CYP4A11 was significantly altered following major blunt trauma and its level was correlated with the Injury Severity Score, indicating its role in the pathophysiological response to traumatic injury [Brandfellner et al. DOI:10.1097/SHK.0b013e31829de02f].