Basic Information

Symbol
CYP4V2
RNA class
mRNA
Alias
Cytochrome P450 Family 4 Subfamily V Member 2 CYP4AH1 Cytochrome P450, Family 4, Subfamily V, Polypeptide 2 Docosahexaenoic Acid Omega-Hydroxylase CYP4V2 Long-Chain Fatty Acid Omega-Monooxygenase Cytochrome P450 4V2 EC 1.14.14.79 EC 1.14.14.80 EC 1.14.14.1 BCD
Location (GRCh38)
4:186191475-186215245
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_207352.4
Sequence length
4657.0 nt
GC content
0.4361

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1371.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1461.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1267.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_207352.4 NCBI
CGGUCUUUCGCUUUCGGCUGGGGCGUGGAGGCCGCGGUGCUGCGUAGGC… 4657 nt 0.4361
Summary

This gene encodes a member of the cytochrome P450 hemethiolate protein superfamily which are involved in oxidizing various substrates in the metabolic pathway. It is implicated in the metabolism of fatty acid precursors into n-3 polyunsaturated fatty acids. Mutations in this gene result in Bietti crystalline corneoretinal dystrophy. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that major blunt trauma triggers a selective change in gene expression in circulating leukocytes, with the CYP4V2 being among the top ten down-regulated genes following injury [Brandfellner et al. DOI:10.1097/SHK.0b013e31829de02f]. A study in Lucilia sericata demonstrated that the CYP4V2 transcript levels were highest with lowest variation at 0-2 hours and significantly decreased as development proceeded, enabling its use for egg age prediction [Tarone et al. DOI:10.1111/J.1556-4029.2007.00587.X]. Generalized additive models incorporating its expression data, along with other genes, explained up to 76.7% of deviance and achieved 91% of predictions within 2 hours of true age, supporting the feasibility of using gene expression for precise postmortem interval estimation.