Basic Information

Symbol
CYP51A1
RNA class
mRNA
Alias
Cytochrome P450 Family 51 Subfamily A Member 1 LDM P450-14DM P450L1 CYPL1 CYP51 CP51 Cytochrome P450, Family 51, Subfamily A, Polypeptide 1 Cytochrome P450, 51 (Lanosterol 14-Alpha-Demethylase) Lanosterol 14-Alpha Demethylase Sterol 14-Alpha Demethylase Cytochrome P450 51A1 Cytochrome P450-14DM Cytochrome P45014DM Cytochrome P450LI CYPLI EC 1.14.14.154 EC 1.14.13.70
Location (GRCh38)
7:92084987-92134803
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000786.4
Sequence length
3155.0 nt
GC content
0.4105

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-917.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -975.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 725.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000786.4 NCBI
AGUAGGAGACCUGGGGCAAGGCCCCCUGUGGACGACCAUCUGCCAGCUU… 3155 nt 0.4105
NM_001146152.2 NCBI
ACAGAGCGCGCCGUCGCCGCUCGAGCUCGCCCUGAGAUCCCUCCGCUCA… 2988 nt 0.3963
Summary

This gene encodes a member of the cytochrome P450 superfamily of enzymes. The cytochrome P450 proteins are monooxygenases which catalyze many reactions involved in drug metabolism and synthesis of cholesterol, steroids and other lipids. This endoplasmic reticulum protein participates in the synthesis of cholesterol by catalyzing the removal of the 14alpha-methyl group from lanosterol. Homologous genes are found in all three eukaryotic phyla, fungi, plants, and animals, suggesting that this is one of the oldest cytochrome P450 genes. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that major blunt trauma triggers a selective upregulation of oxidative enzyme transcripts in circulating leukocytes, with the CYP51A1 being significantly upregulated and its expression level correlated with APACHE II clinical trauma scores [Brandfellner et al. DOI:10.1097/SHK.0b013e31829de02f].