Basic Information

Symbol
CYSLTR2
RNA class
mRNA
Alias
Cysteinyl Leukotriene Receptor 2 CYSLT2R G-Protein Coupled Receptor GPCR21 G-Protein Coupled Receptor HG57 CysLT(2) HGPCR21 CYSLT2 HPN321 Cysteinyl Leukotriene CysLT2 Receptor PSEC0146 KPG_011 CysLTR2 GPCR21 HG57
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_001308476.3
Sequence length
4763.0 nt
GC content
0.4126

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1328.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1421.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1120.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(.(((((((((..((.(((....))).))..))))((((.((((((.(((((..((((((((..(((.....))).(((((((.((.((.........)).))..........(((((((.(((...)))))))))))))))))..((((.(((.(((((..(((((...(((...(((((((...........(((((((...((((((((((((.(((((.....)))..)).).)))))...))))))...))).))))))))))).)))...)))))...)))))))))))).....((((((((..(((.((((((.((((.....))))..)))))).(.(((((((.((..........((((.(((((...((((((.(((((.((...(((((((((.(((((.....((((((((((((....(((((((((((((((((((((.(((......))).)))))..))))))......((((((...(((((.(((...))).)))))...))))))..((((((((......(((((((....(((((.......(((((((((......))...((((((.....)))))).....))))))).....))))).....))))))).(((......)))(((((((((........)))))).)))(((.(((((((.((.....)).))).)))).)))))))))))..))))).......)))))...(((((((((((............((((((((((((....(((((((((..(((((((...(((((.(((((.(((.((((((..((((....)))).)))))).......)))))))).....)))))....))))..(((((((((((((..(((...)))...)).)))))))))))...............))).)))))).)))...))))))))..)))).((((((((((...))))))))))......))))))))))).)))))).)))))))))))..)))))))))..(((((((((((((((.....(((..(((((.....((((((((((...(((.........(((......))))))...))))))))))...))))))))........))).))))).)))))))...)).)))))..))))))...))))).))))..)).)))...)))).)))).)))))))))))))))).(((.....)))))))).....))))))))))......))))).)...((((((((((..(((((....))))).(((((((((..((....(((((.((((((..(((.(((.(((.......(((.(((.((((.((((...(((.(((((.(((((((((((((......))).)...))))))))).))))).)))...)))).)))).)))....(((((.((.((((((((((..........(((((((((((((...))))))))).))))........(((((................))))).......(((((.(..((((((((...((.(((.....((((((............))))))...))).)).....))))))))....).)))))....))))))))))))..))))).(((((((((((((......((..((((....))))..))...((((((..............))))))....((.((((((((((((((...((((((((((((((..((((((.(.......((.....((((((((.((((.....)))))))................((..((..((((....((((((((((((...((((((((((.((((.....((((((.((..((((.......)))).(((((((...((((((((..(((((((...........(((.......))).(((((((((((((((((.((((.(...).)))))))))))).................(((.((((((((.(((((.((((.((.........)).)))).))))).)))))))).)))..(((((((...)))))))..............((((...(((((..((((((((((.((((.....((((((((((.....))))))))))(((((....))))).......(((.(((.(((((.........))))).))))))...........(((((((((.((((..(((....)))...))))..(((((((((((((.(((.((((.((((....)))))))).))).....))))))))....)))))...........((((((((..(((((.(((..........((((((......))))))(((((((((..((..(((((...(((...........))).)))))..))..))..))))))).........(((((.......))))).))).)))))))))))))..((((.....)))))))))))))...)))).))))))).)))..))))))))).....((((((((((.(((((.........))))).).)))))))))........((((((....))))))...(((((....(((.((((((.(((((((((((((..(((.(((.((((.......))))))).)))..)))))......)))..)))))..)))))).))).......)))))))))))))).))))))).)))))))).....)))))))((((((((.....)))).))))..)))))))).....)))).))))....(((((..(((((((.(((((((((..((((((((((((((..............................))).))).)))))......)))..))))))...((((..(((.((.....(((((....)))))....((((((((((((((((..(....(((((...(((.......))).)).)))...)..))))..)))))))))))).......)))))..)))).))).)))))))))))).........((.......))........))))))..))))))...))))))..))))))..)).((((.((((...(((((......((((((............((((((((....((..((((((((((.(((((((((......((((...............((((((....)))))).(((((.........................)))))...))))....(((((((.((.....(((......))).....)).......)))))))..))))))))).).((..((((...))))..))..)))))))))..))....))))))))....(((.(((((....))))).)))..............)))))))))))......(((((((((....)))))))))...)))).))))........))))).................((((..(((((((........)))))))..)))).(((((((((...(((((......)))))..........(((((((((((.((((((...))))))....((((((((((........))))))))))..(((((((((.((((((((((...(((.....)))((((((((.(((.(.....).)))....((((...((((....))))..))))...........((((((((.....))))))))(((((((((.((((((((((((((((.((((...(((.((((...)))))))...)).))))))))))))))))))....(((....))).....)))))))))((((((((((((.((((..((((((((...((((.(((((((((((((((...))))))))((((......)))).(((((((((((....((....)).....))).))))))))..)))).)))))))....))).......((((((((........)))).))))..(((...(((((....(((((..(((...)))..)))))......))))).))).....((((((...(((((...((.....))...)))))...((((.......))))......((((((((.((..(((....)))..)).))).))))).....((((((((((((...)).))))))))))..))))))...)))))..)))).....))))))))))))..))).))))).((..((((((((((..(((...((((((((..(((((((........)))))))))))).)))....)))))))))))))..))))))))))))))))).))))....))))...))))))).......))))))))).))...).)))))))))))((((.....((((((.((((((.......))))...)).)))))).....))))....................(((......((.....((.(((((..(((...(((((....)))))..)))...))))).))....))......)))..))))))))).........)))))))))))))).))))))).))))))))))).......))).))).)))..))))))...))))).....)).)))))).)))...........................))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,.(((({((((..((.(((....))).))..))))((((.((((((.{,,.({{(({{(((({,(((...,.}}}.{{{{|||,|,,|,........,,..,....}},....(((((((.(((...)))))))))))}}||||..(((,,(((.(((((..(((((...(((...((((((({{.....}},.(((((((.,.((((((((((((.(((((.....)))..)).).))))}..,))))))...))))})))})))))).)))...)))))...))))))))))))},..(((((((((..{{(,((((({.({((.....)))),.}}}))}.{,{{{,({({({{.........{{{|.,||||...{{{{{|,|||||.||,,.{((((((((.(((((.....((((((((((((...,(((((((((({((((((((({.(((......))}.}))}|.|}))))}{{,,..{{{{{{...{((({|({|...)))|))))|,,,}}}})).,|||((((..{{{{((((((,,...,(({((.,,{...,|||{||,,.,,...||...{((((|.....}))))}.,{{{|,,,,,|{|...,))),....}))))}}),{{{......)))(((((((((........)))))).)))|||.|||||||..|},,..,,.,,,.{|||{||,.,,)))))}}))))}......,))))).,.(((((((((((............((((((((((((....{,,((((((..(((((((...(((((.(((((.(((.((((((..((((....)))).)))))).......)))))))).....)))))....)))).,(((((((((((((..(({...)))...)).))))))))))),..............))).)))))).}},...))))))},,})))).((((((((((...))))))))))......))))))))))).)))))).)))))))))))..)))))))))..(((((((((((((((....{(((,.{{(((.....((((((((((...(((........,{{{......))))))...))))))))))...))))))))........))).))))).)))))))...}}.}))))..))}|}|{{{||||,.,,,....)})))}}},)}..,))).))))))))),,|||||.||,))},.)))))))))}..,))))))))))......))))).}...((((((((((,.(((((....))))).{{(((((((..{{.{{.(((((.((((((..(((.((({({({{.(((((((.(((.((((.((((,..(((.(((((.((((((((({{(({,....)))}....))))))))).))))).))).},)))).)))).)))((((.......)))}.{({....,,,...((((((,{(((((((((...})))))))).||||{,.,......|,}}}}}},,{,....,...........,.,..,|,},,.,,,,(((((,.(..((({..((((((((...{{.{{,....)))))..{{(((.((((((((((({....}})},.{((((...{{((,...,..))))...))))}.,..,,{(({{...,}}},((((....)))))))).))))||}}}},.}))))))).}))).,))))))}.((((((((((((((...((((((((((((((..((((({(({...{{(....,,......(((.((((.....)))))))......,..,....,|||....}}}))))}..((((((((((((...((((((((((.((((.....((((((.{{..((((.......)))).(((((((...((((((((..(((((((.,,........{{{.,,....}}}.((((((((,((((((((.((((.,...,,)))}))))))))..,.,............(((.{(((((((.{((((.((({.((.......,.)).}))).))))}.)))))))}.))).,(((((((...))))))),...,.......,}{{({...(((((..((((((((((.((({{,,.{((((((((((.....))))))))))|{||{....}}}},.,,,...{{{.(((.(((((.........))))).)))})}...........(((((((((,((((..{{{....}}}...)))}.,(((((((((((((,{(({(({{{((((....)))))))).}})})...))))))))....))))).|,.....,,.((((((((,.,((((.(((......,...((((((......))))))(((((((({..((..(((((,,,((,.......,,..)),.)))))..))..},,},)))))).........,((((.....,,)))},.))).)))))))))))))..((((.....)))))))))))))...}))).))))))).)))..)))))}}}}.....(((((((((,{({(((.........)))),,).)))))))))........((((((....)))))).,{(((((.,{.(((.((((((.((((((({(((((..(((.(((.((((......,))))))).)))..}))))......))),.}))))..)))))).)))...}...)))))))))))))).))))))).)))))))).....))))))),((((({{.....)))),)}}}..}})))))).....}))).)))),...(((((..(((((((.(((((((((..((((((((((((((..,...,,.......,,.............))).)))},})))......}}}..)))))),..((((..(((.{{.....(((((....)))))....((((((((((((((((..(....(((((...(((.......))).)).)))...)..))))..)))))))))))).......,})))..)))),))).))))))))))))...,,{,..{{.......}}..,...,,})))))..))))))...)))))).{(((((....(((((.{((,,....,,|},..,,.((((({{{{{{{,...,,{((({{((...{((.{((((,((((..(((,,,(({......|||({{{{{{,,......{(((((.,{{{{|||||.(((((.....,,,{{{.,,...((,,.,,.|||}...,{{{{.{{{(((((((.{,.....(((......))).....)}.......))))))}..,})))})))}).,{..((((...,}}).,))}.})))),)))}.},....)))))),,.,..(((.(((((....))))).)))....,,,..,,....,},.}}},,,....,||||{|{{{|,...,}})))))),,,,.|{{{{.{,,....,,))).}.....,...........((((..(((((((........)))))))..)))).}||}}.......)))))))}}}.|}||||...,,,,,{((((({{,,,,.{(((({...||||}}....((((((((((........)))))))))).,||||,|,||,|||,||}})},}}|||}}}}})),,|||||}}}}.}}}..||..,}||,...,,{,...{(((....}))|,,|,,,.}}},..,,,,||,,(((({{{{{|,,....)|||{|||||}((((((((((((((((.((((...(((.(((,...}))))))...)).)))))))))))))))))).,,.{((,...)})..||{,||||||,,((((((((((((.((((..(((((...((((((.....,.))))))(((({{{,{{||||{((((,,,,,,}}}|,((((((((,{{....{{....)}.....}}}.))))))))..}))),}|)))},....}.,.......((((((((........))))}})))..(((...(((((....(((((..(((...}))..)))))......))))).})}...,{{{{,,,.,,{((((,..{,.,...,,...})))}...||||,,....|||||......|||,||||,||,||||}}}}),)}}))})}}.},,,,,.,,.((((((((((((...)).)))))))))}...,}}}}...)))))..)))).....)))))))))))).}).)})}.}},....|||||||,,|}}|||.,,,{{{({(,.{(((((((........))))))))}})}.,,,..{{|||||,,,||||,.{{(((|||.||,,|}|||,,}},,},.||||...})))})},|||..}}||||{((((.....))))))))},,,,|||||,.}}.))))))}}.,||}}..}}})))).{||||}|,{{{{{,{{||||{{....|........,....}))}.....}})}}}}}|.,{|,.,,|||...,{{{,,...,,},,)))))....)))))).......)}})}......))))))))).........))))))))))))))})))))))))))).))),)).......,,..))).)))..))))))...))))).....)).))))))}.}}..........,,.,.......,,.,.,))))))))))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4740 nt 0.4122
Showing 11 to 11 of 11 entries
Summary

The cysteinyl leukotrienes LTC4, LTD4, and LTE4 are important mediators of human bronchial asthma. Pharmacologic studies have determined that cysteinyl leukotrienes activate at least 2 receptors, the protein encoded by this gene and CYSLTR1. This encoded receptor is a member of the superfamily of G protein-coupled receptors. It seems to play a major role in endocrine and cardiovascular systems. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for CYSLTR2 Gene

Forensic Context

A study in rats demonstrated that ultraviolet-B irradiation induced transcriptional changes in the L4 and L5 dorsal root ganglia, where the CYSLTR2 was significantly up-regulated with a fold change of 1.8 [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].