Basic Information

Symbol
CYYR1
RNA class
mRNA
Alias
Cysteine And Tyrosine Rich 1 C21orf95 Proline-Rich Domain-Containing Protein Cysteine And Tyrosine-Rich Protein 1 Cysteine/Tyrosine-Rich 1
Location (GRCh38)
21:26466209-26573286
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001320768.2
Sequence length
3099.0 nt
GC content
0.4166

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-842.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -906.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 920.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320768.2 NCBI
GCAGUCGUUGCCACCCGCGGAGAUGAAAUGUGAGCCUGGGUGGCCAAGG… 3099 nt 0.4166
NM_052954.5 NCBI
GCAGUCGUUGCCACCCGCGGAGAUGAAAUGUGAGCCUGGGUGGCCAAGG… 3096 nt 0.4163
Summary

Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue from European Australians with alcohol use disorder (AUD) demonstrated that the mRNA for the CYYR1 was downregulated in the caudate nucleus, cerebellum, and hippocampus of AUD subjects [Lim et al. DOI:10.1038/s41398-021-01635-w].