Basic Information

Symbol
DARS1
RNA class
mRNA
Alias
Aspartyl-TRNA Synthetase 1 DARS Cell Proliferation-Inducing Gene 40 Protein Aspartate TRNA Ligase 1, Cytoplasmic Aspartate--TRNA Ligase, Cytoplasmic Aspartyl-TRNA Synthetase EC 6.1.1.12 AspRS Aspartyl-TRNA Synthetase, Cytoplasmic Testicular Tissue Protein Li 192 HBSL
Location (GRCh38)
2:135905881-135986100
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001349.4
Sequence length
3099.0 nt
GC content
0.3814

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-773.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -837.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1034.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001293312.1 NCBI
GAGACCCUGCGCGCGGCCGCCAGCGCUCCGGGAUCUCGAGAUAGCCGCA… 3113 nt 0.3877
NM_001349.4 NCBI
AUCUUUCUGGAGCCGCACCUCCACGCGGAGUCCGAGCGCGUGUGCUGAG… 3099 nt 0.3814
Summary

This gene encodes a member of a multienzyme complex that functions in mediating the attachment of amino acids to their cognate tRNAs. The encoded protein ligates L-aspartate to tRNA(Asp). Mutations in this gene have been found in patients showing hypomyelination with brainstem and spinal cord involvement and leg spasticity. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2014]

Forensic Context

A study in differentiated human SH-SY5Y neuronal cells demonstrated that exposure to specific PFAS compounds (PFOS, 8:2 FTOH, and 8:2 FTS) consistently upregulated the DARS1, which is involved in tRNA aminoacylation, identifying it as a potential molecular indicator of PFAS-induced neurotoxicity [Running et al. DOI:10.1021/acschemneuro.4c00652].