Basic Information

Symbol
DBX2
RNA class
mRNA
Alias
Developing Brain Homeobox 2 Developing Brain Homeobox Protein 2 Homeobox Protein DBX2 FLJ16139
Location (GRCh38)
12:45014672-45051099
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001004329.3
Sequence length
2806.0 nt
GC content
0.4601

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-878.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -932.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 608.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001004329.3 NCBI
AUCGUUCCAAGUCCGCCGCCGUCCCGGGUGGCCUUUCCUCCCUGCCUGG… 2806 nt 0.4601
Summary

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to act upstream of or within several processes, including G2/M transition of mitotic cell cycle; epidermal growth factor receptor signaling pathway; and neural precursor cell proliferation. Predicted to be located in chromatin. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in zebrafish demonstrated that the DBX2 transcript, a spinal cord development transcription factor, increased in abundance at 0.3 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].