Basic Information

Symbol
DCAF6
RNA class
mRNA
Alias
DDB1 And CUL4 Associated Factor 6 PC326 IQWD1 Androgen Receptor Complex-Associated Protein IQ Motif And WD Repeat-Containing Protein 1 Nuclear Receptor Interaction Protein DDB1- And CUL4-Associated Factor 6 IQ Motif And WD Repeats 1 ARCAP NRIP 1200006M05Rik MSTP055
Location (GRCh38)
1:167935783-168076223
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001198956.2
Sequence length
3486.0 nt
GC content
0.4426

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-995.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1061.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1034.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001017977.3 NCBI
GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… 3213 nt 0.4404
NM_001198956.2 NCBI
GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… 3486 nt 0.4426
NM_001198957.2 NCBI
GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… 3393 nt 0.4456
NM_001349773.2 NCBI
GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… 3444 nt 0.4445
NM_001349774.2 NCBI
UUCUCCCCAUGCCCUCGAGGCCAUGUUGGAGAAGGGAAAGUGAAGCUGC… 3218 nt 0.4186
NM_001349775.2 NCBI
GGAUGUUCUGGAAGAAGAGAAUUUAUCCAAAGAUUAAAACUUGAAGCAA… 2957 nt 0.4126
NM_001349776.2 NCBI
GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… 3086 nt 0.4255
NM_001349777.2 NCBI
GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… 3211 nt 0.4429
NM_001349778.2 NCBI
UUCUCCCCAUGCCCUCGAGGCCAUGUUGGAGAAGGGAAAGUGAAGCUGC… 3158 nt 0.4177
NM_001349779.2 NCBI
GGAUGUUCUGGAAGAAGAGAAUUUAUCCAAAGAUUAAAACUUGAAGCAA… 2897 nt 0.4115
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a ligand-dependent coactivator of nuclear receptors, including nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 (NR3C1), glucocorticoid receptor (GR), and androgen receptor (AR). The encoded protein and DNA damage binding protein 2 (DDB2) may act as tumor promoters and tumor suppressors, respectively, by regulating the level of androgen receptor in prostate tissues. In addition, this protein can act with glucocorticoid receptor to promote human papillomavirus gene expression. [provided by RefSeq, Mar 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.