Basic Information

Symbol
DCBLD2
RNA class
mRNA
Alias
Discoidin, CUB And LCCL Domain Containing 2 CLCP1 ESDN CUB, LCCL And Coagulation Factor V/VIII-Homology Domains Protein 1 Endothelial And Smooth Muscle Cell-Derived Neuropilin-Like Protein Discoidin, CUB And LCCL Domain-Containing Protein 2 Coagulation Factor V/VIII-Homology Domains Protein 1 1700055P21Rik
Location (GRCh38)
3:98795941-98901729
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_080927.4
Sequence length
6128.0 nt
GC content
0.4181

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1763.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1873.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1416.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((......))..))).(((((((((...((.(((((..((((((.....(.(((((((((.(.(......).).))))))))).)..)))))).))))).)))))))))))(((((.(((((((((((((((((.((((((.(((((..((((...))))..))))))))))).)))))))))))).((((((((((..(((...(((((((.(((((((((.((((....(((((((((.((.((..((((.((.(((.((((((((((((((...((.((((((((((((((((((.((((....(((.(...).))))))).)))))))).))....)))).)))).))((((((((.....)))).)))))))))))).)))))).))).)).))))...)).)))))..((((((((.(.(((....))).).))))))))))))))..))))...)))).)))))...)))))))...))).))))))))))(((((.(((.((((((.............(((((((((((((((((((.((....)).))))..))).)))..(((((((((...(((..(((..(((((......(((((.........))))).....((((.((((((..(((((....(((.....)))..)))))............((((.(((......))).))))...((((.((((((((((((((.(((((((.(....................).))))))).)))))...))))))))).))))......((((.......))))))))))))))..........(((((((..(((((.....(((((((......)))))))))))))))))))(((((.((((....)))).)))))...)))))..)))..)))......((((((((.........))))))))((((((((.(((((....)))))..(((.(..((((....)))).))))((((.(((((((........))..))))).))))......((((((((.((((.(((....)))(((((.....)))))..)))).)))).))))))))))))....((((((...(((((((......(((((((......(((.....))))))))))......)))))))..))))))))))))))))))))))))..(((((((..(((((.........)))))..)))))))....))))))..))).)))))(((......))).))))))))))......((((((.....))))))..((((.....)))).(((((((((((..(((.......(((((.....(((((.........)))))......)))))))))))))))).))).......((((((((((..(((.(.((((...................)))))))).)))))))))).....((((((((((.((((.......))))))))))(((((....)))))((((((..((((((..((((((((((.(.((..(((.((.((.((((((...(((((..(.((((...))))...)..)))))...((((((((((((((...............)))).))))))))))....(((((..(((......(((((((.......)))))))......)))..)))))(((((.(..((((....)))).).))))).................))))))..))..(((((((((......(((((((((((...(((((((..((((..(((...))).....(((((((((.(((((((.((...((((((.(((.((((((.........(((((((((((((...((...((((((.((.(((((.....(((................)))......))))))).))))))))..)))).))))..))))).((((((((((((((((..(((..(((((....((((((.......)))))))))))..))).))........)).))).))).))))))...(.(((((((.(((((((((...((((.(((((((......))))))).))))....(((((((((..((.((....)))))))))))...))((((((...(((.........(((((.((((((((..(((((((((((((((.....))))))).((((((((((((.(((..((((((((.(((....))).)))......(((((((((((.........))))).......(((.....))).....))))))........(((.(((((((.((......)).))))).)).)))....))))...)..))))).))))))))))..............((((..(((.(((((......((((....))))....)))))..))))))).............(((((.......))))))))).)))).............))))))))...)))))))).)))))))))..)))).))))))))).).(((.((((..((((((..((.(((....)))))))))).)...)))).))).((((((.(((((...(((((((((((((((((((((((.((((((((((..(((((.((..((((((.....((((((((((((((((...........)))))))).((((((((.(((((...(((((((((((((((((((((((((((((((...))))))).....))))))))))..)))))))))))))).(((((..(((.....)))...))))).......)))))..))))))))(((((((((((((((.......))).)))).........((((((.....))))))......((((...............))))(((((((((((((....((((..(((((((...............((((((.......)))))).(((((.(((((......((((((.((((.....))))..((((((......)).)))).....))))))......))))))))))..((((((((..........((((((((((.((((((((((...........(((.............)))...........))))).)))))...(((.((....)).))).............))))))))))..........)))))))))))))))..))))........)))))..)))))))).....)))))))))))))))))))))).)).))))).......((..((......))..))(((...)))..((.(((....))).))...))))))))))..........((((((((..(((((((((((((((((..(((((((....(((((....(((.((((((((.(((....((((.((.((((....((....)))))).))))))...))).)))(((((((...(((((....)))))......(((((((((((....(((((....)))))...)))).....))))))))))))))...)))))...)))....)))))..((((............)))).))))))).)))))))).)))))))))(((((((.(((((...........((((((((........))))))))......(((((...................)))))....))))).))))))).........((((((....))))))....((((((.....))))))................((((..(((.((.....((((((((..((((.(..(((......)))..).))))...))))))))....))))).))))...))))))))...(((....)))..((((....))))..))))))))))))))....((..((((.(((((((...(((.((((...........)))).)))....)))))))....(((((.....)))))........))))..))....(((((..(((((((((((.(((((((((((.....)))).(((...)))(((((((.((((((..(((....(((((((((...(((...((((((....)))))))))...))))))))).((.(((((.....))))).)).......((((.((((....)))).))))....((((((...(((((......((((((((..((((.(((((.....)))))))))..)))...)))))........)))))..))))))((((((((((.(((....))).)))))).))))....)))..)))))).))))))).....((((...........)))).....(((((......((((((.((((........((((((((((((((.....((((((((((((...))))))))))))..((((.(((.................))).)))).(((((.....))))).......(((..((.((((.........)))).))..))).....))))))))))))))))))))))))......)))))..(((((......)))))........))))))))))))))))))...)))))((((((..(((((...........))))))))))))))))))))...)))))..)))))))))))).....)))))))))...)).)))).)))..))))))))).........))))..))))))).)))))))).)))..............((((.(..((((((((.((.(((((((((....(((......)))...(((.(((((((....((((....)))).))))))).)))(((((((....((((.((((((((((...((.......(((......))).......))..)))))))).)).))))....)))))))((((((((............................(((((((.....)))))))......((....))(((((((((((.......(((((........)))))..........(((..((.((((((((...((((....((((...((((((...((((.(.........))))).))))))....))))...))))..)))))))).))..)))..((((.....))))((((...(((((...........)).)))...)))))))))))))))..))))))))))))))))....).)).))))))))..).))))............))))))...)))...((.((((....)))).))..)).))).)))))))))))))..))))))...))))))..((((...)))).......))))((((((........))))))((((.((((((((((((.((((.....))))....((((((((((((..((((((((((.(((.....))))))))).)).))(((...((((......))))...)))(((((....))))).(((((((((.((.......((........))....)).))))))))).((((((((((.(...(((((((...((.((((((.(....((((...(((..(((((..((........))..)).)))..))).))))..((((((((...(((((......((((...)))).....))))).))))))))............).))))))))....)))))))..).)))))))))))))))))))))).(((((..(((((((((....((((((((((((....))))))...........((((((((((((((..(((.(((((((...))))))))))..........((((((((((.(((.(.....).)))..)))))))))).((((((((..(((((...))))).))))))))((((((.((((.......)))).))))))....))))))))))))))((((..........)))).....)))))).)))))))))............))))))))))))).)))).)))).).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({{(,.,,,.,||.,|||.((((((((({.{,{.(((((..((((((.....(.(((((((((.(,(......).).))))))))).)..)))))).))))),))))))))))){{||,,|{{||{(((((((((((.((((((.(((((..((((...))))..))))))))))).)))))))))))}.((((((((((.{(,(,..(((((((.(((((((((.((((....(((((((((.((.((..((((.(({({{.((((((((((((((,{(((,(((((((((((({({{{|.||||,,,}|||,,,,,}||||||}}.)))))))),}}...,}})).}}}).)}((((((((,...,)))).)))))))))))).)))))).))),)}.))))...)).)))))..((((((((.(.(((....))).}.))))))))))))))..}))),}.)))).)))))...))))))).,.,)).))))))))))((((({(((.((((,({{{.((,,...{{(({{(,((.,,,||.|{,|,||,,.}),}))),..)))}}))}.|||||,(((,...||}.|||.,}}}}}}.,,.{((((({{....{{.,,,||{{{({,,,,,(((((({{((((({{{(,{({{{{{|,|,.}}|,|,......{{{{{({({,({{..{{{{{||{||{({..((((.((((((((((((((.(((((((.(.....,..............}.))))))).)))))...))))))))).))))..}}}.,{{(,,.....}}}}||}}}}||||{,,...,,,.{{({{{{..|||||,....(((((((....,.|||||||||||,||||}||,,,(({,((({{{{,|||{|||||{(((,((|{{{.|.{(({.,{{{,({((((((|......,.))))))}|((((((({.(((((....))))).,{,{,||||{({|||.}},|{{|||{,{|,{|{{|||.....,,,)),})}||||}|||......((({{{{(.{{{{.(((....)))(((((.....)))))..)))).)))),))))))))))))....{(((((...(((((((..,.,.(((((({,{{...,((....,})))))))))...,..)))))))..)))))),,|,||{|||||||||{{,.{((((((..(((((.........)))))..))))))},...},}})}.||||||}}}}{((,,.,,.}}},})}}))))))......((((((.....))))))..((((.....)))).(((((((((((..(((,.,,...{{{{{.....(((((.{.......))))).,....}))))))))))))))).))).......((((((((((.,{,,.,.{{{{...................}}}},,}}.)))))))))).|{{{{...{|||||,((((.......)))))}}|}}{{|||....)))))}||,||}}|,||,|}}||||,,,|||}|,,|}}|||,|,}||.((((((...((((((...,{{,..{||,........,,,}...{(((((((((((((...............))))}}))))))))}....(((({..(((......(((((((.......)))))))......)))..}))))(((((.{..{({{....}))}.}.))))),......}}}}.}}...)))))),}})}}})}||||||}}}...{{{((((((((...(((((((.,((((..(({...}}}.....(((((((((.({(((((.((.,,((((((.(((.((((((.........(((((((((((((...{,...((((((.((.(((((.....(((....,...........))}......))))))).))))))}}..))))}}))}.,))))).((((((((((((((,,..(((..(((((....((((((.......)))))))))))..))).})........)),})).))).))))))...{.(((((((.((((((,((,{,,.(({{((((((......))))))))),||,...||(((((((..((.((....)))))))))))...|}((((((...,,,.......,.(((((.((((((((,.(((((((((((((((.....})))))).((((((((((((.((((({(({((,,((,{((({.....,,),))}.||}||.)))|,..}))))..,{((({..,,..(((.....)))....}}...))))).....(((.(((((((.((......)).))))).)).))).....,|{{......)))),})))))))))....,,........{(((..(({.(((((...{{,(,{{....)))))...)))))..)}})))}.......},....(((((.......))))))))).)))),............})))))))...))))),},.)))))))))..)))).))))))))).},(((,{{{,..{(((((..(,{(((....)))))))))).}...,})),)),.((((((.(((((...(((((((((((((((((((((((.((((((((((..{((({.((.,((((((.....|||||||(((((((((...........)))))))),{(((((((.(((((...{((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))},...,})))))))},.}))))))))))))}.(((((..(((.....)))...))))).......)))))..)))))))}{((((((((((((({.......))).)))),{{,,.,..,{((((,...,||}}}}{{,....|||||},,.,,,,,,,,,}},.(((((((((((((....((((..((((((({..,..,.,,....,,|{|||,..,.{({..(((((((((.,,,,,..,..,{{((({.((({.....}))}..((((((......)).)))).,,,.}}}}}}..||{,,,,,|{({.{{.,.||,||}},|},,}|,.((((((((((.,{{,,{{({,...........{((.............)))...........}}},|{|||||...(({.{{,...}}.))).,..,,,,..,,,))))))))))..,}}}}))))))))}}))))))))..)))}.,....,,))))}..)))))))).....)))))))}}}}}}||||}}}}}.)),))))),.|,,,,{{..((,,,,,.}}..}}|||,.,},|.,{|||||....))}})).,,)))))))))},,,,,,,,..{(((((((..(((((((((((((((((..(((((((....(((((....(((.((((((((.(((....((((.((.((({...,((....)))))).))))))...))).))}{((((((...(((((....)))))......(((((((((((.,..(((((....)))))...)))).....)))))))))))))}...)))))...)))....)))))..((((............)))).))))))).)))))))).))))))))}{{{{{{{.{{{{{.........{.((((((((........)))))))}......,,,,,.,|},,........,,,,,|||},.,,,)))}}.}}}}||||,,......((((({....})))))....((((((.....))))))..,...,,,,,.....((((..((({{{.....((((((((..((((.{,{((,....},)}}..}.))))...)))))))),.},)}))).))))...)))))))}.,,(((....)))..{(({....)))).,))))))))))))))....(({{((((,(((((((...(((.((((...........)))).)))....)))))))....(((((.....)))))........,}}}..,,..,.{{{({..(((((((((({,(((((((((((.....)))).(((...))){((((((.((((((..(((.....{{((((((...(((...((((((....)))))))))...))))))}}|,((.(((((.....))))).)).,}....((((.((((....)))).))))....((((((...(((((..,.,.((((((((..((((.(((((,...,)))))))))..)))...))))}.....,}.)))))..))))))((((((((((.{({....})}.)))))).))))....)))..)))))).))))))}.....((((...........)))).....{((((......((((((.((((........((((((((((((((.....((((((((((({...})))))))))))..((((.{((.................))}.)))).(((((.....))))).......(((..((.((((.........)))).))..))).....))))))))))))))))))))))))......))))},,(((((......))))).,,.....))))))))))))))))))...)}}||((({{{..,,,,,......,,}}}))))))))))))))))))))...)))))..)))))))))))}.....))))))))}...)).))})))))..)))))))))........,)))}..))))))).)))))))).|||,,{{,....,,,,,||{|,,..||||||||}|}}}((((((((.((({{({,,,,.,,,....,{,(((({({....((((....)))).,}))})),))},,{{{,{....{((({((((({,((({{.,,.......|||,,..,,})),},,...,,...,)))))),}},)}},..,,|||||||{...,,,,................,,,,,,......(((((((.....)))))))......|}}}}},.{((((((((((..,....(((((........}}}}}.........{(((..((.((((((({...((((.,..{(({...((((((...{(((.{.........})))).))))))....)))).,.))))..)))))))).))..))),.((((.....))))((((...((({{...........}}.)))...)))))))))))))))..,))))...))))))))....,....)))))))))),.)))},.}}})))....,,)),)...}}}}}}}|},|,|}}}})),,..)}))))))).)),,))))))),,..)),,,,}}})))))(((((((.{,.(({.(((((.....))))).,.)).},)))))))((((.((((((((((((.,,(({...{||||,{{,{(((((((((((..{{((((((((.(((.....))))))))).)).}|(({,,,{(,{......},},...}}}(((({....))))).(((((((((.((.......{{........))....)).))))))))).{(((((((((.{...{{(((((.,.{{.((((((.,....((((...(((..(({((..((........))..)).)))..))).}}}}..(((((((({(.{((((.....,((({...,}}}.....}))))}))))))))...,..,,,,,,}.))))))))..,,)))))))..}.)))))))))))))))))))))))){{,,..(((((((((....{({{{{((((((....)))))).,,........((((((((((((({..(((.(((((((...))))))))))..........((((((((((.({{.,.....},)))..)))))))))).{{{{(({(,.((((,,,,|}|||,|}}}}}}}{{{{{{.||{{...,..,)))).)))))}....,))))))))))))),{{|,.......,,||||....,)))))).))))))))),}},},......))),.)))))))).)))).)))).}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_080927.4 NCBI
GGGCCUGCCUGCCAGCUAGCCGGAGCCGCGGGUGAGCGCGGCGAGCGGC… 6128 nt 0.4181
Summary

Predicted to enable signaling receptor activity. Involved in negative regulation of cell growth and wound healing. Located in cell surface and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A single-cell transcriptomic analysis in a rat model of radiation-induced lung injury identified the DCBLD2 as an orthologous rat gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].