Basic Information

Symbol
DCC
RNA class
mRNA
Alias
DCC Netrin 1 Receptor IGDCC1 NTN1R1 Immunoglobulin Superfamily DCC Subclass Member 1 Deleted In Colorectal Carcinoma Colorectal Cancer Suppressor Tumor Suppressor Protein DCC Netrin Receptor DCC Immunoglobulin Superfamily, DCC Subclass, Member 1 Putative Colorectal Tumor Suppressor HGPPS2 CRC18 CRCR1 MRMV1
Location (GRCh38)
18:52340197-53535899
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005215.4
Sequence length
10181.0 nt
GC content
0.4324

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2883.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3092.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2671.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005215.4 NCBI
GCACACCGCUGGCGGACACCCCAGUAACAAGUGAGAGCGCUCCACCCCG… 10181 nt 0.4324
Summary

This gene encodes a netrin 1 receptor. The transmembrane protein is a member of the immunoglobulin superfamily of cell adhesion molecules, and mediates axon guidance of neuronal growth cones towards sources of netrin 1 ligand. The cytoplasmic tail interacts with the tyrosine kinases Src and focal adhesion kinase (FAK, also known as PTK2) to mediate axon attraction. The protein partially localizes to lipid rafts, and induces apoptosis in the absence of ligand. The protein functions as a tumor suppressor, and is frequently mutated or downregulated in colorectal cancer and esophageal carcinoma. [provided by RefSeq, Oct 2009] CIViC Summary for DCC Gene

Forensic Context

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