Basic Information

Symbol
DCHS2
RNA class
mRNA
Alias
Dachsous Cadherin-Related 2 PCDHJ CDHJ PCDH23 CDHR7 CDH27 Cadherin-Related Family Member 7 Cadherin-Like Protein CDHJ Protein Dachsous Homolog 2 Cadherin-Like Protein VR8 Protocadherin PCDHJ Cadherin-Like 27 Protocadherin-23 FLJ20047 Dachsous 2 (Drosophila) Protocadherin 23 Protocadherin J Cadherin-27 Cadherin J
Location (GRCh38)
4:154231742-154491799
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001358235.2
Sequence length
13354.0 nt
GC content
0.4583

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4189.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142552.2 NCBI
ACUCCACCCCCUACUCCGGCCAGAUCCCCAUCCUCUCCUUGUGUGUGCG… 5147 nt 0.5452
NM_001358235.2 NCBI
ACUCCACCCCCUACUCCGGCCAGAUCCCCAUCCUCUCCUUGUGUGUGCG… 13354 nt 0.4583
NM_001412223.1 NCBI
ACUCCACCCCCUACUCCGGCCAGAUCCCCAUCCUCUCCUUGUGUGUGCG… 5143 nt 0.5456
Summary

This gene encodes a large protein that contains many cadherin domains and likely functions in cell adhesion. Genome-wide association studies suggest that this gene may be important in Alzheimer's disease, compressive strength index, and appendicular lean mass. [provided by RefSeq, May 2017]

Forensic Context

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