Basic Information

Symbol
DDOST
RNA class
mRNA
Alias
Dolichyl-Diphosphooligosaccharide--Protein Glycosyltransferase Non-Catalytic Subunit OST48 KIAA0115 WBP1 OST Dolichyl-Diphosphooligosaccharide--Protein Glycosyltransferase 48 KDa Subunit Advanced Glycation End-Product Receptor 1 Oligosaccharyl Transferase 48 KDa Subunit Oligosaccharyltransferase Subunit 48 Dolichyl-Diphosphooligosaccharide--Protein Glycosyltransferase Subunit (Non-Catalytic) Dolichyl-Diphosphooligosaccharide-Protein Glycosyltransferase Dolichyl-Diphosphooligosaccharide-Protein Glycotransferase Advanced Glycation Endproduct Receptor 1 Oligosaccharyltransferase 48 KDa Subunit DDOST 48 KDa Subunit EC 2.4.1.119 OKSWcl45 AGER1 CDG1R GATD6
Location (GRCh38)
1:20651767-20661544
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005216.5
Sequence length
1941.0 nt
GC content
0.5291

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-705.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -741.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 501.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005216.5 NCBI
CUUCGGCAGGAGGAGGAAGAUGGAGCCCAGCACCGCGGCCCGGGCUUGG… 1941 nt 0.5291
Summary

This gene encodes a component of the oligosaccharyltransferase complex which catalyzes the transfer of high-mannose oligosaccharides to asparagine residues on nascent polypeptides in the lumen of the rough endoplasmic reticulum. The protein complex co-purifies with ribosomes. The product of this gene is also implicated in the processing of advanced glycation endproducts (AGEs), which form from non-enzymatic reactions between sugars and proteins or lipids and are associated with aging and hyperglycemia. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the DDOST gene, which is involved in the protein processing of endoplasmic reticulum pathway, within microglial cells [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].